More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2154 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  81.77 
 
 		 1039 aa  1629    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 1041 aa  2071    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.87 
 
 		 1004 aa  465  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  36.92 
 
 		 696 aa  344  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.79 
 
 		 1363 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  32.68 
 
 		 1236 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  32.48 
 
 		 947 aa  300  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 1221 aa  300  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  32.48 
 
 		 1831 aa  299  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.76 
 
 		 1163 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.73 
 
 		 1652 aa  294  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  34.44 
 
 		 1364 aa  285  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  31.85 
 
 		 1510 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.36 
 
 		 1481 aa  278  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  31.35 
 
 		 1523 aa  278  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  31.41 
 
 		 1454 aa  273  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  31.12 
 
 		 1553 aa  271  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 		 1686 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  36.81 
 
 		 1217 aa  262  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.8 
 
 		 1193 aa  257  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31.04 
 
 		 1247 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.32 
 
 		 1557 aa  254  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1196 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.39 
 
 		 1188 aa  252  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.79 
 
 		 1357 aa  251  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.78 
 
 		 1190 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  30.3 
 
 		 1789 aa  246  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.51 
 
 		 1213 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.75 
 
 		 930 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  32.25 
 
 		 1474 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.94 
 
 		 1901 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.39 
 
 		 919 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.05 
 
 		 1807 aa  235  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  31.47 
 
 		 1443 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.22 
 
 		 1711 aa  233  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.98 
 
 		 1262 aa  232  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1229 aa  230  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30.2 
 
 		 1714 aa  229  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.36 
 
 		 1760 aa  224  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  31.96 
 
 		 1656 aa  222  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  32.71 
 
 		 1661 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1552 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  30.62 
 
 		 1211 aa  214  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.22 
 
 		 1868 aa  213  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.65 
 
 		 1188 aa  212  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  28.6 
 
 		 1161 aa  212  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  28.55 
 
 		 1161 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1367 aa  211  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.46 
 
 		 1348 aa  207  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  29.82 
 
 		 1280 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  39.66 
 
 		 316 aa  205  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.62 
 
 		 1208 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  30.51 
 
 		 1177 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  29.16 
 
 		 1176 aa  201  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.33 
 
 		 1164 aa  201  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.23 
 
 		 1484 aa  201  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.82 
 
 		 1609 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  29.51 
 
 		 1304 aa  200  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  30.84 
 
 		 1766 aa  199  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.98 
 
 		 1599 aa  197  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  37.8 
 
 		 344 aa  196  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  29.24 
 
 		 1190 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.36 
 
 		 676 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.27 
 
 		 1242 aa  192  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  35.9 
 
 		 1878 aa  191  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  25.08 
 
 		 1330 aa  188  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.68 
 
 		 924 aa  188  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  36.61 
 
 		 344 aa  187  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1214 aa  186  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  39.49 
 
 		 742 aa  186  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  35.05 
 
 		 317 aa  184  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.52 
 
 		 682 aa  184  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1209 aa  183  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  31.14 
 
 		 1399 aa  183  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  27.68 
 
 		 608 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.2 
 
 		 1684 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  26.6 
 
 		 1016 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.7 
 
 		 1583 aa  181  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  35.09 
 
 		 316 aa  181  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.86 
 
 		 630 aa  180  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  26.44 
 
 		 1016 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1427 aa  178  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  40.52 
 
 		 577 aa  177  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1858 aa  177  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  27.32 
 
 		 1311 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  39.34 
 
 		 335 aa  177  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.13 
 
 		 1623 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  36.18 
 
 		 443 aa  175  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  34.15 
 
 		 316 aa  174  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.04 
 
 		 1626 aa  174  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  24.04 
 
 		 728 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  36.52 
 
 		 434 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  36.24 
 
 		 335 aa  173  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  35.89 
 
 		 316 aa  172  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.26 
 
 		 664 aa  171  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  25.96 
 
 		 1373 aa  171  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.02 
 
 		 1607 aa  171  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.36 
 
 		 677 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.16 
 
 		 1598 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.99 
 
 		 1416 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>