More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1424 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  100 
 
 
344 aa  664    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  90.12 
 
 
344 aa  597  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  53.94 
 
 
740 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  52.44 
 
 
1163 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  52.71 
 
 
1789 aa  329  5.0000000000000004e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  51.06 
 
 
1363 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  45.15 
 
 
1652 aa  316  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  50 
 
 
1364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  47.52 
 
 
696 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  49.24 
 
 
1510 aa  303  4.0000000000000003e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  50.76 
 
 
1599 aa  302  6.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  47.85 
 
 
1236 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.94 
 
 
1481 aa  302  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  48.48 
 
 
1553 aa  299  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  46.31 
 
 
947 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  44.21 
 
 
1523 aa  294  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.07 
 
 
1686 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  44.06 
 
 
1221 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  46.08 
 
 
1196 aa  275  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  45.9 
 
 
1878 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  49.38 
 
 
1656 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  42.2 
 
 
1552 aa  271  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  42.12 
 
 
1193 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  43.2 
 
 
1454 aa  268  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  37.14 
 
 
1247 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.06 
 
 
1711 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  45.43 
 
 
1229 aa  262  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.4 
 
 
1760 aa  262  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  39.82 
 
 
1474 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.03 
 
 
677 aa  259  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  44.82 
 
 
1831 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  41.35 
 
 
1858 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  39.18 
 
 
1188 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.26 
 
 
676 aa  256  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  46.08 
 
 
1714 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  44.83 
 
 
657 aa  252  7e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  37.96 
 
 
1661 aa  251  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  43.07 
 
 
1367 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.4 
 
 
1262 aa  250  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  43.12 
 
 
1217 aa  248  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40.43 
 
 
1868 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  49.68 
 
 
1443 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  45.54 
 
 
1357 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  45.54 
 
 
919 aa  242  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  42.06 
 
 
924 aa  241  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  41.69 
 
 
1901 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.61 
 
 
1557 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  38.91 
 
 
1304 aa  235  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  37.32 
 
 
1213 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.72 
 
 
630 aa  235  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  37.77 
 
 
1208 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.32 
 
 
664 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.33 
 
 
1240 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  42.3 
 
 
434 aa  230  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  40.18 
 
 
1348 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  48.26 
 
 
335 aa  228  9e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  38.86 
 
 
1807 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  45.16 
 
 
443 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  46.74 
 
 
872 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.46 
 
 
576 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  35.77 
 
 
1190 aa  225  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.93 
 
 
682 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  44.41 
 
 
778 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  42.96 
 
 
1164 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  42.3 
 
 
1766 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  44.63 
 
 
742 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  38.24 
 
 
317 aa  222  9e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.83 
 
 
930 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  43.1 
 
 
774 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  40.68 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.91 
 
 
1623 aa  218  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  39.21 
 
 
1211 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  45.07 
 
 
342 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  41.27 
 
 
1176 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  40.54 
 
 
1161 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  40.54 
 
 
1161 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  38.28 
 
 
464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.47 
 
 
1599 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  36.15 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.88 
 
 
642 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  31.1 
 
 
1188 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.08 
 
 
1267 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  37.54 
 
 
316 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.39 
 
 
1547 aa  212  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  38.38 
 
 
335 aa  212  9e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.86 
 
 
1607 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  45.14 
 
 
780 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  36.27 
 
 
316 aa  211  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.72 
 
 
596 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.36 
 
 
692 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37 
 
 
1609 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  40.23 
 
 
1177 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  37.56 
 
 
1183 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  38.7 
 
 
687 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  35.49 
 
 
316 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  35.99 
 
 
1411 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  33.6 
 
 
1214 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  49.16 
 
 
675 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  48.47 
 
 
540 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.26 
 
 
1004 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>