More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2355 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 
316 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  82.91 
 
 
316 aa  546  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  76.9 
 
 
316 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  76.36 
 
 
316 aa  510  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  73.97 
 
 
316 aa  498  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  72.7 
 
 
335 aa  490  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  69.4 
 
 
317 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  41.87 
 
 
1652 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  41.14 
 
 
1364 aa  246  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  41.81 
 
 
1363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  43 
 
 
696 aa  242  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  41.64 
 
 
1193 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  42.16 
 
 
1163 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  40.41 
 
 
1523 aa  238  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  39.45 
 
 
947 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  38.56 
 
 
1236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  38.72 
 
 
1221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.89 
 
 
1686 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  43.17 
 
 
742 aa  219  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  37.72 
 
 
1474 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  38.38 
 
 
1454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.34 
 
 
630 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  37.98 
 
 
1188 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  39.93 
 
 
1789 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  39.73 
 
 
1510 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.73 
 
 
1481 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  34.94 
 
 
344 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.12 
 
 
676 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  35.49 
 
 
344 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  37.38 
 
 
434 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  41.07 
 
 
1878 aa  205  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  39.86 
 
 
1553 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.06 
 
 
1557 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  39.33 
 
 
1357 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.71 
 
 
740 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.9 
 
 
677 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  33.67 
 
 
657 aa  198  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  37.63 
 
 
1443 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  37.85 
 
 
1599 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  36.21 
 
 
1247 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.71 
 
 
1711 aa  195  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.35 
 
 
930 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  34.15 
 
 
1831 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  31.49 
 
 
1188 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.11 
 
 
664 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  35.44 
 
 
464 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  38.73 
 
 
577 aa  192  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.88 
 
 
919 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.98 
 
 
1262 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  35.25 
 
 
1416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.27 
 
 
1868 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  37.76 
 
 
1211 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  36.51 
 
 
778 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.47 
 
 
1760 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  34.98 
 
 
1552 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 
1196 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.84 
 
 
682 aa  185  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  35.78 
 
 
1661 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  34.6 
 
 
443 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.37 
 
 
1348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.06 
 
 
1240 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  35.17 
 
 
1280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  42.86 
 
 
1656 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  38.26 
 
 
1217 aa  178  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  35.74 
 
 
1714 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  33.95 
 
 
578 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.03 
 
 
1623 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  34.06 
 
 
1901 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  32.64 
 
 
1213 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  33.45 
 
 
565 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.98 
 
 
1609 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  40.07 
 
 
675 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  36.01 
 
 
335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.63 
 
 
1599 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.99 
 
 
1208 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.24 
 
 
1598 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  31.72 
 
 
1367 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  34.15 
 
 
1041 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.49 
 
 
1547 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  36.65 
 
 
1229 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.79 
 
 
1583 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  34.62 
 
 
1161 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  34.62 
 
 
1161 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.49 
 
 
792 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  34.11 
 
 
1190 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  33.67 
 
 
1858 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.83 
 
 
1807 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 
576 aa  165  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  38.67 
 
 
790 aa  165  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  30.9 
 
 
687 aa  165  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  33.9 
 
 
346 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  32.89 
 
 
1411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.14 
 
 
737 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  33 
 
 
774 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  32.17 
 
 
1164 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.44 
 
 
1004 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.33 
 
 
692 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  32.68 
 
 
342 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  40.27 
 
 
540 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.97 
 
 
1267 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>