More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2226 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 
464 aa  942    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  40.35 
 
 
1523 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  45.26 
 
 
1163 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  44.56 
 
 
1364 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  44.91 
 
 
947 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  42.51 
 
 
1363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40.28 
 
 
1652 aa  239  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  44.17 
 
 
1236 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  38.93 
 
 
696 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.14 
 
 
677 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  39.65 
 
 
1454 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.61 
 
 
1686 aa  232  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  38.89 
 
 
1188 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  38.89 
 
 
1221 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.6 
 
 
676 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.92 
 
 
664 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  39.65 
 
 
589 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  38.95 
 
 
1789 aa  219  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  37.54 
 
 
344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.54 
 
 
692 aa  218  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  37.8 
 
 
774 aa  216  5.9999999999999996e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  38.28 
 
 
344 aa  216  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  40.35 
 
 
434 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  34.8 
 
 
1213 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  39.38 
 
 
778 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  38.11 
 
 
1510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 
687 aa  214  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.21 
 
 
740 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  38.16 
 
 
1553 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  35.35 
 
 
1193 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.7 
 
 
1711 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  38.6 
 
 
657 aa  211  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.89 
 
 
698 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.94 
 
 
630 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  36.62 
 
 
1599 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.1 
 
 
682 aa  210  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  37.5 
 
 
1196 aa  209  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.06 
 
 
1481 aa  209  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  40.97 
 
 
346 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.51 
 
 
1240 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.05 
 
 
930 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  42.14 
 
 
1656 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  38.18 
 
 
1443 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  38.6 
 
 
316 aa  204  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.97 
 
 
1557 aa  202  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  32.41 
 
 
1474 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  34.74 
 
 
317 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  36.14 
 
 
1878 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  35.74 
 
 
1247 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  31.82 
 
 
1280 aa  200  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.08 
 
 
576 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.47 
 
 
1868 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  34.26 
 
 
1831 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  39.02 
 
 
578 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  38.21 
 
 
742 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  37.25 
 
 
1858 aa  196  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  35.44 
 
 
316 aa  193  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  33 
 
 
1552 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  31.82 
 
 
1416 aa  193  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.92 
 
 
1190 aa  192  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  34.49 
 
 
316 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  35.44 
 
 
1661 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.08 
 
 
1188 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.99 
 
 
1357 aa  190  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.13 
 
 
1208 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  32.87 
 
 
1242 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  35.59 
 
 
342 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  32.56 
 
 
335 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  33.8 
 
 
316 aa  188  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  34.74 
 
 
335 aa  187  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  33.68 
 
 
316 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.47 
 
 
596 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.88 
 
 
1760 aa  186  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.23 
 
 
1901 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  38.2 
 
 
443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.78 
 
 
733 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.58 
 
 
919 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  34.38 
 
 
1176 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  33.57 
 
 
565 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  35.53 
 
 
589 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.11 
 
 
1217 aa  182  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.58 
 
 
1583 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.12 
 
 
1609 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  30.82 
 
 
505 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.14 
 
 
642 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  35.57 
 
 
577 aa  180  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.04 
 
 
792 aa  179  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 
1807 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  35.47 
 
 
540 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  32.88 
 
 
1177 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  34.18 
 
 
597 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.56 
 
 
1262 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.52 
 
 
1004 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.68 
 
 
636 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  34.05 
 
 
1714 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  34.69 
 
 
728 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.77 
 
 
1598 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.62 
 
 
1267 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  33.33 
 
 
608 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.21 
 
 
608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>