More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0173 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 
346 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  59.82 
 
 
334 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  41.52 
 
 
363 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  41.52 
 
 
363 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  43.67 
 
 
1364 aa  229  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  43.4 
 
 
1363 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  38.01 
 
 
1523 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40.14 
 
 
1652 aa  222  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  40.62 
 
 
1163 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  40.68 
 
 
696 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.3 
 
 
677 aa  215  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.91 
 
 
676 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  40.72 
 
 
1236 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  40.97 
 
 
464 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  38.49 
 
 
1789 aa  203  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  39.12 
 
 
774 aa  199  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  39.02 
 
 
947 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  35.93 
 
 
1193 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.3 
 
 
1686 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  36.05 
 
 
589 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  37.8 
 
 
1221 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  37.88 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.8 
 
 
692 aa  195  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  36.46 
 
 
1213 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.69 
 
 
682 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  36.86 
 
 
344 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  41.28 
 
 
1443 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.33 
 
 
919 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  35.2 
 
 
1454 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  37.04 
 
 
657 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  39 
 
 
687 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  38.04 
 
 
443 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.85 
 
 
1196 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  33.64 
 
 
1599 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  36.99 
 
 
1474 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  33.33 
 
 
1280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  39.1 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  38.64 
 
 
778 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.64 
 
 
1760 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  37.92 
 
 
578 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.83 
 
 
1557 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.56 
 
 
1240 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.06 
 
 
664 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  34.47 
 
 
1247 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.91 
 
 
1481 aa  179  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.37 
 
 
740 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  35.71 
 
 
1858 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  36.73 
 
 
1553 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  34.02 
 
 
1878 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.19 
 
 
576 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  36.84 
 
 
1348 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.55 
 
 
698 aa  176  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  32.78 
 
 
1831 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  36.39 
 
 
1510 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  37.67 
 
 
608 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.23 
 
 
630 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.72 
 
 
1868 aa  173  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  35.76 
 
 
1208 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  33.56 
 
 
1188 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  34.1 
 
 
826 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.67 
 
 
930 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  36.54 
 
 
742 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  34.98 
 
 
1190 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  33.22 
 
 
1552 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  32.88 
 
 
316 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.67 
 
 
675 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.1 
 
 
1711 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.33 
 
 
1357 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  33.33 
 
 
505 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  34.94 
 
 
335 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.97 
 
 
924 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  36.12 
 
 
1217 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.68 
 
 
792 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.85 
 
 
737 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.08 
 
 
1807 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.03 
 
 
608 aa  166  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  33.9 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.38 
 
 
716 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.01 
 
 
1262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.77 
 
 
1484 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  31.31 
 
 
1416 aa  162  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.86 
 
 
642 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  35.48 
 
 
540 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  36.36 
 
 
342 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  32.83 
 
 
589 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  34.24 
 
 
335 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  32.76 
 
 
1477 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  36.74 
 
 
565 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  37.29 
 
 
1656 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.82 
 
 
1188 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  32.3 
 
 
1242 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  37.5 
 
 
1176 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  30.19 
 
 
1367 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  32.87 
 
 
728 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  30.42 
 
 
564 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.59 
 
 
1901 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 
1311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.63 
 
 
596 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  33.68 
 
 
1211 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  30.48 
 
 
316 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>