More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2471 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  49.8 
 
 
1229 aa  677    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.81 
 
 
1686 aa  723    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.27 
 
 
1240 aa  776    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.67 
 
 
1711 aa  688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
1481 aa  3036    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  72.71 
 
 
1553 aa  2199    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  37.35 
 
 
1236 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  79.3 
 
 
1510 aa  2303    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.62 
 
 
1760 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  58.18 
 
 
1656 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.09 
 
 
1357 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  51.13 
 
 
1789 aa  571  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  40.93 
 
 
1163 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.73 
 
 
1583 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.47 
 
 
1598 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  48.36 
 
 
1367 aa  539  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  47.04 
 
 
1523 aa  528  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  45.23 
 
 
1652 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  40 
 
 
1363 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.77 
 
 
1344 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.04 
 
 
1217 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  47.93 
 
 
1831 aa  500  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  46.26 
 
 
696 aa  495  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  39.1 
 
 
947 aa  496  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  47.69 
 
 
1552 aa  495  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.65 
 
 
1626 aa  473  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  32.65 
 
 
1221 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.44 
 
 
1557 aa  456  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  41.34 
 
 
919 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  40.67 
 
 
1364 aa  441  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  41.05 
 
 
1193 aa  443  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  42 
 
 
1454 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  41.84 
 
 
1196 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  29 
 
 
1334 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  39.65 
 
 
1211 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  44.5 
 
 
1766 aa  426  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  41.28 
 
 
1868 aa  422  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  29.95 
 
 
1491 aa  416  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  42.63 
 
 
1443 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.09 
 
 
1684 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.54 
 
 
1599 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  39.52 
 
 
1474 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.14 
 
 
1823 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  29.42 
 
 
1657 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  35.76 
 
 
1164 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  37.71 
 
 
1188 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.39 
 
 
1609 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  42.08 
 
 
1661 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  41.27 
 
 
1714 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  38.84 
 
 
924 aa  396  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.15 
 
 
1262 aa  392  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.02 
 
 
1547 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  38.37 
 
 
1176 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.56 
 
 
1607 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.61 
 
 
1623 aa  390  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  28.28 
 
 
1265 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.21 
 
 
1398 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  40.14 
 
 
1161 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  40.9 
 
 
1161 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.91 
 
 
1617 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  37.24 
 
 
1247 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  36.3 
 
 
1190 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  35.19 
 
 
1901 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.92 
 
 
1399 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.91 
 
 
1348 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  35.73 
 
 
1213 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  48.13 
 
 
1599 aa  365  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  38.33 
 
 
1177 aa  361  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  37.41 
 
 
1416 aa  360  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  34.88 
 
 
1214 aa  353  8.999999999999999e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  32.52 
 
 
1304 aa  346  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  34.82 
 
 
1208 aa  343  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  27.64 
 
 
1733 aa  343  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  25.95 
 
 
1699 aa  343  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 
1264 aa  343  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 
1264 aa  343  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  36.44 
 
 
1209 aa  342  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  36.28 
 
 
1807 aa  340  9e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.99 
 
 
930 aa  339  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  27.95 
 
 
1183 aa  334  7.000000000000001e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  37.09 
 
 
1858 aa  330  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  31.1 
 
 
1373 aa  329  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  52.63 
 
 
740 aa  326  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.17 
 
 
1267 aa  321  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.47 
 
 
1856 aa  319  3e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  36.59 
 
 
1280 aa  318  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  33.83 
 
 
1411 aa  310  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  27.89 
 
 
1355 aa  305  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  48.94 
 
 
344 aa  304  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  48.94 
 
 
344 aa  303  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  31.65 
 
 
1016 aa  302  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  35.38 
 
 
608 aa  301  6e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  31.56 
 
 
1016 aa  301  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  35.19 
 
 
728 aa  298  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  33.7 
 
 
1242 aa  294  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  33.69 
 
 
1100 aa  292  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  35.67 
 
 
505 aa  291  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  31.8 
 
 
902 aa  290  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  30.43 
 
 
1209 aa  286  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  32.42 
 
 
1311 aa  284  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>