More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2751 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 1355 aa  2621    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.24 
 
 		 1357 aa  386  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  33.06 
 
 		 1334 aa  376  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  33.74 
 
 		 1344 aa  356  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  34.13 
 
 		 994 aa  324  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1553 aa  309  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  28.27 
 
 		 1230 aa  300  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 		 1481 aa  300  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1510 aa  283  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.26 
 
 		 1686 aa  277  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1657 aa  276  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  29.15 
 
 		 1265 aa  259  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.25 
 
 		 1236 aa  257  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.72 
 
 		 1711 aa  254  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.61 
 
 		 1599 aa  244  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.76 
 
 		 919 aa  239  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.78 
 
 		 1240 aa  237  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.59 
 
 		 1217 aa  227  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.11 
 
 		 1623 aa  222  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.11 
 
 		 1760 aa  220  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.97 
 
 		 1609 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  28.39 
 
 		 1699 aa  205  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  37.54 
 
 		 696 aa  204  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1401 aa  203  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.9 
 
 		 1583 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.84 
 
 		 1684 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  27.84 
 
 		 1733 aa  197  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.66 
 
 		 1363 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.37 
 
 		 924 aa  195  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 1221 aa  194  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.7 
 
 		 1196 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.62 
 
 		 1823 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1491 aa  191  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.64 
 
 		 1598 aa  184  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1399 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.38 
 
 		 1557 aa  181  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  31.86 
 
 		 1656 aa  179  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  31.7 
 
 		 1364 aa  178  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.04 
 
 		 1652 aa  178  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.54 
 
 		 1229 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.21 
 
 		 1188 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.75 
 
 		 1163 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.79 
 
 		 1831 aa  174  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.58 
 
 		 1547 aa  171  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  36.39 
 
 		 652 aa  169  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.34 
 
 		 1256 aa  168  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.6 
 
 		 737 aa  168  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.79 
 
 		 1901 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.66 
 
 		 1807 aa  162  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1424 aa  162  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.13 
 
 		 716 aa  161  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  30.06 
 
 		 1789 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.94 
 
 		 828 aa  159  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.49 
 
 		 1411 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.19 
 
 		 1193 aa  155  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1599 aa  154  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.71 
 
 		 947 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  54.48 
 
 		 564 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 901 aa  152  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  44.03 
 
 		 934 aa  152  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.92 
 
 		 682 aa  152  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1211 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27 
 
 		 1474 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.02 
 
 		 1552 aa  148  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26 
 
 		 1626 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  47.77 
 
 		 358 aa  147  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.25 
 
 		 833 aa  147  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.67 
 
 		 1208 aa  147  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  37.16 
 
 		 405 aa  145  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  46.56 
 
 		 715 aa  145  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.41 
 
 		 1213 aa  144  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.05 
 
 		 1188 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.71 
 
 		 1247 aa  142  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.53 
 
 		 1161 aa  142  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1190 aa  141  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.49 
 
 		 1161 aa  141  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.76 
 
 		 865 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.91 
 
 		 1164 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1714 aa  140  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  26.97 
 
 		 1308 aa  139  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  36.59 
 
 		 344 aa  139  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  35.41 
 
 		 344 aa  138  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  36.13 
 
 		 385 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.47 
 
 		 729 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  48.03 
 
 		 850 aa  135  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  47.17 
 
 		 405 aa  135  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.61 
 
 		 1242 aa  135  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.31 
 
 		 930 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  24.53 
 
 		 1330 aa  134  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.95 
 
 		 675 aa  133  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  133  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  49.64 
 
 		 161 aa  132  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  35.36 
 
 		 1194 aa  132  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1073 aa  132  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  42.76 
 
 		 911 aa  131  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.2 
 
 		 1858 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  31.57 
 
 		 1078 aa  130  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1117 aa  129  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  28.28 
 
 		 902 aa  128  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 		 1190 aa  128  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>