More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5886 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 		 865 aa  1696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  70.69 
 
 		 833 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  68.54 
 
 		 641 aa  361  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  68.42 
 
 		 721 aa  360  8e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  60.88 
 
 		 734 aa  354  4e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  61.48 
 
 		 898 aa  325  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  61.34 
 
 		 828 aa  323  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  59.63 
 
 		 932 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.89 
 
 		 585 aa  293  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  57.41 
 
 		 644 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  57.14 
 
 		 611 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  62.36 
 
 		 723 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  54.79 
 
 		 612 aa  268  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  55.43 
 
 		 573 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.82 
 
 		 729 aa  264  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  48.94 
 
 		 771 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  51.12 
 
 		 528 aa  257  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.37 
 
 		 716 aa  257  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.49 
 
 		 599 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.19 
 
 		 520 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  38.05 
 
 		 569 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  42.86 
 
 		 1344 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  52.45 
 
 		 589 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  54.89 
 
 		 624 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  54.58 
 
 		 560 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  54.81 
 
 		 613 aa  250  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  54.15 
 
 		 624 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  58.71 
 
 		 520 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 		 481 aa  245  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  56.81 
 
 		 676 aa  243  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  47.53 
 
 		 555 aa  242  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.15 
 
 		 421 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  49.49 
 
 		 652 aa  241  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.36 
 
 		 1481 aa  240  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  43.07 
 
 		 1553 aa  240  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.53 
 
 		 814 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.44 
 
 		 737 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  46.5 
 
 		 590 aa  238  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 716 aa  238  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  56.03 
 
 		 616 aa  237  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  47.91 
 
 		 608 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  45.9 
 
 		 455 aa  235  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  47.86 
 
 		 569 aa  235  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 535 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  42.48 
 
 		 1510 aa  231  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  48.48 
 
 		 542 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  47.92 
 
 		 547 aa  229  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  46.24 
 
 		 360 aa  228  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  51.32 
 
 		 594 aa  227  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  48.46 
 
 		 571 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  51.32 
 
 		 604 aa  226  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.18 
 
 		 481 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  45.35 
 
 		 820 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.33 
 
 		 557 aa  226  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.55 
 
 		 673 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  48.86 
 
 		 564 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 		 638 aa  224  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  50.98 
 
 		 608 aa  224  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  47.67 
 
 		 680 aa  223  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 		 586 aa  223  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  48.53 
 
 		 637 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.11 
 
 		 761 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 		 695 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  36.47 
 
 		 1163 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.24 
 
 		 490 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  48.74 
 
 		 620 aa  222  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  48.87 
 
 		 587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  42.26 
 
 		 405 aa  221  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  50 
 
 		 496 aa  221  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  44.65 
 
 		 544 aa  220  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  48.54 
 
 		 637 aa  220  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  39.77 
 
 		 1357 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  38.73 
 
 		 1367 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.22 
 
 		 751 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.45 
 
 		 664 aa  217  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 		 548 aa  218  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.42 
 
 		 600 aa  217  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0668  Serine/threonine protein kinase-like protein  45 
 
 		 464 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 694 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  42.86 
 
 		 919 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 		 644 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  44.91 
 
 		 292 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  53.03 
 
 		 597 aa  215  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.85 
 
 		 587 aa  215  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  45.07 
 
 		 550 aa  215  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  47.53 
 
 		 630 aa  213  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 541 aa  213  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  46.15 
 
 		 601 aa  212  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 		 870 aa  212  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.67 
 
 		 612 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.04 
 
 		 806 aa  211  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  50.98 
 
 		 551 aa  210  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0669  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.67 
 
 		 975 aa  210  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0315888  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  47.71 
 
 		 673 aa  210  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  38.23 
 
 		 1599 aa  210  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.14 
 
 		 682 aa  210  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.82 
 
 		 1148 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.87 
 
 		 1652 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.96 
 
 		 1256 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  40.99 
 
 		 646 aa  209  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0259009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>