More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4788 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  100 
 
 
723 aa  1394    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  62.6 
 
 
828 aa  292  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  59.86 
 
 
833 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  54.87 
 
 
721 aa  290  8e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  57.3 
 
 
898 aa  282  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  62.36 
 
 
865 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  59.14 
 
 
806 aa  281  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  54.58 
 
 
734 aa  277  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  50.95 
 
 
932 aa  266  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  56.75 
 
 
611 aa  266  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  51.69 
 
 
835 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.06 
 
 
729 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.76 
 
 
585 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  52.08 
 
 
814 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  51.03 
 
 
613 aa  253  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.24 
 
 
421 aa  252  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 
589 aa  251  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  46.77 
 
 
555 aa  249  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  51.15 
 
 
481 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  47.55 
 
 
528 aa  246  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  52.54 
 
 
624 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.35 
 
 
644 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
573 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.7 
 
 
557 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
564 aa  243  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  51.69 
 
 
612 aa  243  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.82 
 
 
599 aa  243  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  50.97 
 
 
535 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  49.24 
 
 
587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  55.21 
 
 
616 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.15 
 
 
569 aa  239  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.97 
 
 
520 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  48.92 
 
 
608 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  46.85 
 
 
569 aa  237  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.67 
 
 
761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  47.65 
 
 
637 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  44.93 
 
 
820 aa  233  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
676 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
571 aa  231  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  48.11 
 
 
590 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  45.92 
 
 
646 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  48.66 
 
 
586 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  49.61 
 
 
490 aa  229  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
292 aa  229  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  47.86 
 
 
716 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.23 
 
 
612 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.46 
 
 
751 aa  227  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  53.91 
 
 
520 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  46.01 
 
 
547 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.09 
 
 
600 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.04 
 
 
673 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  44 
 
 
481 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  45.42 
 
 
360 aa  224  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.3 
 
 
624 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  49.25 
 
 
837 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  50.56 
 
 
694 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0807  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.63 
 
 
1190 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 
455 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  48.11 
 
 
638 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  48.3 
 
 
604 aa  220  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  49.21 
 
 
560 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  48.26 
 
 
560 aa  218  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  48.65 
 
 
544 aa  217  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.8 
 
 
1148 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.85 
 
 
641 aa  216  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
542 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  44.96 
 
 
652 aa  214  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.47 
 
 
587 aa  214  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.95 
 
 
608 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  40.4 
 
 
771 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  44.07 
 
 
637 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  47.55 
 
 
548 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  47.79 
 
 
673 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6929  serine/threonine protein kinase  47.66 
 
 
352 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 
594 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  42.35 
 
 
870 aa  211  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  47.41 
 
 
416 aa  210  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.56 
 
 
664 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.92 
 
 
1256 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  46.21 
 
 
620 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  43.46 
 
 
514 aa  208  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  46.77 
 
 
618 aa  208  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  50.21 
 
 
632 aa  208  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  46.24 
 
 
541 aa  207  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.91 
 
 
716 aa  207  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  41.48 
 
 
696 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  48.63 
 
 
624 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 
644 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  42.66 
 
 
550 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0668  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.27 
 
 
464 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.31 
 
 
603 aa  204  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0669  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.08 
 
 
975 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0315888  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  45.11 
 
 
542 aa  204  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2699  serine/threonine protein kinase  46.52 
 
 
743 aa  204  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0467419  normal  0.85773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  46.69 
 
 
870 aa  203  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  44.02 
 
 
780 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  46.83 
 
 
597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2305  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.77 
 
 
617 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  39.32 
 
 
623 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>