More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2000 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
597 aa  1129    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  59.5 
 
 
547 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  56.98 
 
 
542 aa  299  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  55.67 
 
 
557 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  53.41 
 
 
820 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  56.01 
 
 
608 aa  293  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  56.38 
 
 
637 aa  289  9e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  51.94 
 
 
687 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  57.31 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  57.03 
 
 
742 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  53.11 
 
 
550 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  56.34 
 
 
644 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  52.25 
 
 
716 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  58.27 
 
 
716 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  59.43 
 
 
870 aa  273  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  52.63 
 
 
618 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  54.98 
 
 
620 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  56.23 
 
 
680 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  53.23 
 
 
630 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  52.48 
 
 
522 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  52.56 
 
 
837 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  47.16 
 
 
870 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  49.31 
 
 
696 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  50.5 
 
 
564 aa  256  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  53.61 
 
 
721 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  52.47 
 
 
734 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  53.79 
 
 
594 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  50.56 
 
 
932 aa  253  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  47.47 
 
 
623 aa  253  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  53.36 
 
 
573 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  52.27 
 
 
604 aa  252  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4894  serine/threonine protein kinase  54.96 
 
 
558 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  48.61 
 
 
589 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  48.68 
 
 
586 aa  247  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  50.56 
 
 
835 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  48.07 
 
 
771 aa  244  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.55 
 
 
585 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  50.97 
 
 
612 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4722  serine/threonine protein kinase  47.5 
 
 
749 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
421 aa  240  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.09 
 
 
569 aa  240  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  50.76 
 
 
638 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.35 
 
 
644 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 
601 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  50.75 
 
 
544 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  48.53 
 
 
637 aa  237  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  46.85 
 
 
569 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  50.76 
 
 
548 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  51.98 
 
 
729 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
613 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4116  serine/threonine protein kinase  57.2 
 
 
514 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  51.74 
 
 
611 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  51.52 
 
 
624 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  46.97 
 
 
608 aa  233  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 
695 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  46.56 
 
 
528 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  49.63 
 
 
833 aa  231  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.59 
 
 
599 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  53.03 
 
 
865 aa  229  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 
694 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  47.86 
 
 
806 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.65 
 
 
898 aa  226  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.06 
 
 
520 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  48.48 
 
 
541 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2433  serine/threonine protein kinase  52.63 
 
 
526 aa  224  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263911  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  50 
 
 
641 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0668  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.22 
 
 
464 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  48.28 
 
 
564 aa  223  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  49.24 
 
 
481 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  44.49 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5095  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
585 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0160466  normal  0.222813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2698  serine/threonine protein kinase  45.07 
 
 
696 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.152894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  47.73 
 
 
514 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  49.47 
 
 
646 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 
555 aa  220  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2699  serine/threonine protein kinase  44.76 
 
 
743 aa  220  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0467419  normal  0.85773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8723  serine/threonine protein kinase  55.76 
 
 
770 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196332  normal  0.0764847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.29 
 
 
828 aa  219  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  47.92 
 
 
587 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
292 aa  217  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.7 
 
 
751 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.28 
 
 
481 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.17 
 
 
761 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.67 
 
 
587 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6929  serine/threonine protein kinase  52.23 
 
 
352 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  44.52 
 
 
652 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.7 
 
 
600 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.1 
 
 
612 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0360  serine/threonine protein kinase  50.39 
 
 
508 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 
589 aa  213  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  45.04 
 
 
360 aa  213  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  47.19 
 
 
551 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  50.95 
 
 
520 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4679  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 
590 aa  211  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.94 
 
 
673 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 
624 aa  210  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  46.83 
 
 
617 aa  210  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  42.01 
 
 
560 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  47.1 
 
 
560 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  47.53 
 
 
590 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.25394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>