More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3419 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 
898 aa  1760    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  69.28 
 
 
806 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  60 
 
 
833 aa  314  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  60.38 
 
 
721 aa  310  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  65.31 
 
 
865 aa  309  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  53.68 
 
 
828 aa  296  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.92 
 
 
835 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  51.52 
 
 
932 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  52.13 
 
 
734 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  55.85 
 
 
641 aa  284  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  55.51 
 
 
611 aa  273  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
555 aa  270  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  50.17 
 
 
573 aa  267  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.94 
 
 
585 aa  263  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  53.1 
 
 
644 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.04 
 
 
421 aa  259  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  50.39 
 
 
569 aa  258  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  57.3 
 
 
723 aa  257  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  53.08 
 
 
771 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  53.7 
 
 
729 aa  251  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  52.75 
 
 
613 aa  250  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
528 aa  248  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.12 
 
 
520 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  49.44 
 
 
716 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
586 aa  244  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.41 
 
 
814 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  40.06 
 
 
455 aa  243  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.39 
 
 
599 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  51.06 
 
 
520 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
608 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
624 aa  237  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.91 
 
 
490 aa  237  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  49.04 
 
 
481 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  56.39 
 
 
616 aa  234  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  49.04 
 
 
589 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  49.24 
 
 
612 aa  232  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  48.66 
 
 
652 aa  230  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
604 aa  229  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.1 
 
 
751 aa  228  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.14 
 
 
687 aa  227  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
587 aa  227  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  45.02 
 
 
569 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
820 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  50.95 
 
 
594 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.88 
 
 
557 aa  224  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  48.46 
 
 
544 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  43.89 
 
 
638 aa  223  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  47.19 
 
 
564 aa  220  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  45.82 
 
 
571 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
624 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  46.25 
 
 
695 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.02 
 
 
761 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 
535 aa  219  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 
360 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0668  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.69 
 
 
464 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  45.53 
 
 
547 aa  218  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
548 aa  218  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.37 
 
 
618 aa  217  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.76 
 
 
673 aa  217  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
676 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.74 
 
 
481 aa  217  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.77 
 
 
716 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  45.86 
 
 
680 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.97 
 
 
600 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  48.65 
 
 
560 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  44.75 
 
 
292 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  46.92 
 
 
637 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4116  serine/threonine protein kinase  54.44 
 
 
514 aa  211  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  48.05 
 
 
742 aa  211  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  43.93 
 
 
541 aa  211  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  45.91 
 
 
637 aa  211  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0669  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.08 
 
 
975 aa  211  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0315888  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  43.51 
 
 
542 aa  210  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  46.59 
 
 
673 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0807  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.69 
 
 
1190 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  43.46 
 
 
601 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.97 
 
 
612 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  43.73 
 
 
560 aa  207  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  49.64 
 
 
589 aa  207  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  45.21 
 
 
608 aa  207  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  43.97 
 
 
590 aa  207  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  46.72 
 
 
632 aa  207  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  47.69 
 
 
780 aa  207  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.36 
 
 
1256 aa  207  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  44.14 
 
 
630 aa  205  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  46.74 
 
 
694 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.3 
 
 
587 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.06 
 
 
603 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  47.88 
 
 
597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  44.79 
 
 
646 aa  202  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  46.95 
 
 
522 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2699  serine/threonine protein kinase  46.77 
 
 
743 aa  201  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0467419  normal  0.85773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4047  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.49 
 
 
916 aa  201  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.56 
 
 
664 aa  201  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.1 
 
 
496 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
551 aa  198  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  45 
 
 
620 aa  197  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  45.21 
 
 
624 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  43.35 
 
 
617 aa  197  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3606  serine/threonine protein kinase  43.82 
 
 
637 aa  196  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.299495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>