More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3002 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 		 835 aa  1599    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  77.26 
 
 		 932 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.48 
 
 		 865 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.35 
 
 		 828 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  58.87 
 
 		 734 aa  303  9e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  58.49 
 
 		 721 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.83 
 
 		 806 aa  292  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.23 
 
 		 833 aa  290  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.92 
 
 		 898 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  52.09 
 
 		 555 aa  281  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  50.15 
 
 		 641 aa  277  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  52.57 
 
 		 528 aa  274  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  53.15 
 
 		 569 aa  272  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  50 
 
 		 585 aa  270  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  53.21 
 
 		 573 aa  268  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  54.47 
 
 		 611 aa  267  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.44 
 
 		 599 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.98 
 
 		 644 aa  259  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 		 771 aa  257  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.09 
 
 		 729 aa  257  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.88 
 
 		 421 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.64 
 
 		 569 aa  255  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.96 
 
 		 520 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  48.91 
 
 		 589 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 		 481 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  46.52 
 
 		 547 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 		 490 aa  237  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  51.69 
 
 		 723 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  47.51 
 
 		 542 aa  234  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 		 624 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  43.98 
 
 		 455 aa  232  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.29 
 
 		 814 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.52 
 
 		 624 aa  232  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 613 aa  232  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  45.95 
 
 		 608 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 612 aa  230  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.32 
 
 		 673 aa  230  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  46.47 
 
 		 590 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.29 
 
 		 608 aa  229  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  47.53 
 
 		 716 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.68 
 
 		 687 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  45.96 
 
 		 695 aa  228  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  47.02 
 
 		 637 aa  228  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  48.46 
 
 		 586 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  48.43 
 
 		 673 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.19 
 
 		 751 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.94 
 
 		 600 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  48.5 
 
 		 604 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  45.66 
 
 		 535 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  44.89 
 
 		 544 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  46.15 
 
 		 644 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  44.93 
 
 		 550 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  45.35 
 
 		 652 aa  221  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 		 637 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.35 
 
 		 761 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 		 571 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 		 560 aa  217  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  45.21 
 
 		 680 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.56 
 
 		 557 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 		 676 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  50.56 
 
 		 597 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  46.59 
 
 		 694 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  46.24 
 
 		 638 aa  215  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  46.59 
 
 		 618 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  45.66 
 
 		 742 aa  214  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.8 
 
 		 716 aa  214  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.97 
 
 		 496 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.06 
 
 		 481 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.74 
 
 		 1256 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.62 
 
 		 587 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 		 564 aa  212  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  43.23 
 
 		 360 aa  211  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  47.49 
 
 		 620 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  47.27 
 
 		 551 aa  211  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  41.95 
 
 		 292 aa  211  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  44.74 
 
 		 541 aa  210  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  48.56 
 
 		 632 aa  210  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  42.26 
 
 		 820 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  44.53 
 
 		 564 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  43.63 
 
 		 601 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  46.69 
 
 		 780 aa  207  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 		 520 aa  207  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  46.97 
 
 		 616 aa  207  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.18 
 
 		 1148 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  45.05 
 
 		 646 aa  206  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  44.24 
 
 		 587 aa  206  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.79 
 
 		 664 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3606  serine/threonine protein kinase  45.36 
 
 		 637 aa  204  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.299495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  38.13 
 
 		 514 aa  204  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2433  serine/threonine protein kinase  44.6 
 
 		 526 aa  204  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263911  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 		 560 aa  204  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  41.61 
 
 		 870 aa  204  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 		 603 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  46.25 
 
 		 617 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  46.74 
 
 		 522 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2375  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.18 
 
 		 651 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  43.4 
 
 		 630 aa  201  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.68 
 
 		 612 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>