More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3395 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 
729 aa  1430    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.01 
 
 
833 aa  482  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.52 
 
 
828 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.87 
 
 
740 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.85 
 
 
932 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  55.73 
 
 
721 aa  268  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  53.87 
 
 
734 aa  266  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  54.28 
 
 
641 aa  261  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.41 
 
 
865 aa  261  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  50.9 
 
 
835 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
573 aa  249  9e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.45 
 
 
898 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.56 
 
 
585 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.25 
 
 
687 aa  245  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.33 
 
 
569 aa  244  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  53.64 
 
 
611 aa  243  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.53 
 
 
806 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  49.44 
 
 
644 aa  239  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.9 
 
 
642 aa  235  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  52.29 
 
 
612 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  50.58 
 
 
637 aa  232  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
481 aa  231  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  47.89 
 
 
586 aa  230  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.89 
 
 
520 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  52.06 
 
 
723 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  45.51 
 
 
771 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.57 
 
 
421 aa  226  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
613 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  51.35 
 
 
624 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.39 
 
 
599 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  42.6 
 
 
555 aa  223  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  49.06 
 
 
541 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.48 
 
 
587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  47.89 
 
 
608 aa  220  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  45.31 
 
 
292 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  42.24 
 
 
716 aa  218  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.96 
 
 
618 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
528 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  47.45 
 
 
564 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  53.05 
 
 
520 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
544 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  43.89 
 
 
590 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  46.77 
 
 
589 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  47.19 
 
 
548 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.32 
 
 
481 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  45.48 
 
 
604 aa  210  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  46.44 
 
 
594 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  41.98 
 
 
455 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
547 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  43.66 
 
 
569 aa  207  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  48.48 
 
 
616 aa  207  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  48.97 
 
 
632 aa  207  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.19 
 
 
673 aa  207  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.55 
 
 
751 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  47.23 
 
 
646 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  47.55 
 
 
694 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  44.98 
 
 
542 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0807  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.04 
 
 
1190 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  50.66 
 
 
597 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  45.26 
 
 
587 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.94 
 
 
496 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  44.96 
 
 
535 aa  204  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  47.73 
 
 
638 aa  204  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.97 
 
 
490 aa  204  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.08 
 
 
600 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.03 
 
 
677 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  45.35 
 
 
680 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.32 
 
 
814 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
870 aa  201  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  45.74 
 
 
514 aa  200  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  45.42 
 
 
742 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2375  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.82 
 
 
651 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  47.31 
 
 
551 aa  198  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7111  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.82 
 
 
1194 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520138  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
560 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  43.7 
 
 
623 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.23 
 
 
1481 aa  197  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  47.43 
 
 
560 aa  197  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.83 
 
 
608 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
652 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  43.58 
 
 
695 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  42.75 
 
 
644 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 
624 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  40 
 
 
1510 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.04 
 
 
612 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.96 
 
 
1148 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  38.89 
 
 
1553 aa  194  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0360  serine/threonine protein kinase  45.63 
 
 
508 aa  194  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.06 
 
 
761 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2433  serine/threonine protein kinase  44.57 
 
 
526 aa  193  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263911  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.15 
 
 
557 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  43.97 
 
 
673 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.84 
 
 
603 aa  191  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  37.37 
 
 
1344 aa  191  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.76 
 
 
1256 aa  191  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.94 
 
 
1262 aa  191  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.21 
 
 
737 aa  191  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  38.41 
 
 
820 aa  190  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  46.46 
 
 
780 aa  190  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
564 aa  190  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>