More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2433 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2433  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
526 aa  1036    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263911  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  55.05 
 
 
544 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
637 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 
608 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.85 
 
 
641 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  51.36 
 
 
542 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  49.31 
 
 
535 aa  227  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  48.51 
 
 
604 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.94 
 
 
716 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  48.07 
 
 
646 aa  223  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.67 
 
 
932 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  42.38 
 
 
696 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.41 
 
 
644 aa  220  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 
542 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  45.72 
 
 
820 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  45.11 
 
 
742 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  45.9 
 
 
589 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  47.69 
 
 
586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  47.55 
 
 
630 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  44.14 
 
 
547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.6 
 
 
835 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  44.88 
 
 
680 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  42.05 
 
 
560 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 
569 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  47.88 
 
 
564 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  52.63 
 
 
597 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  45.11 
 
 
514 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  45.39 
 
 
721 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 
716 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  45.32 
 
 
638 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
421 aa  210  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.71 
 
 
520 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  45.94 
 
 
550 aa  210  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  48.12 
 
 
637 aa  209  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
870 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  42.67 
 
 
771 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.01 
 
 
557 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  46.36 
 
 
573 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  45.98 
 
 
594 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.7 
 
 
687 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.11 
 
 
585 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.21 
 
 
833 aa  205  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  44.91 
 
 
734 aa  205  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.6 
 
 
624 aa  204  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 
601 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  43.54 
 
 
612 aa  204  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  42.54 
 
 
528 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.33 
 
 
806 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 
548 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.91 
 
 
618 aa  203  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  44.07 
 
 
623 aa  203  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.77 
 
 
828 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  47.19 
 
 
551 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  45.28 
 
 
608 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.8 
 
 
729 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  48.15 
 
 
632 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  44.24 
 
 
652 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.04 
 
 
599 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 
555 aa  200  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 
569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0360  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 
508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.06 
 
 
898 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  49.16 
 
 
870 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 
644 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  43.98 
 
 
695 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  47.96 
 
 
694 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  49.36 
 
 
551 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  41.22 
 
 
455 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  46.04 
 
 
560 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4894  serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 
558 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  46.33 
 
 
541 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 
613 aa  194  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.36 
 
 
603 aa  193  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  44.78 
 
 
564 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2474  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
738 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  45.65 
 
 
624 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  42.41 
 
 
416 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0024  serine/threonine protein kinase  45.67 
 
 
572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2699  serine/threonine protein kinase  46.55 
 
 
743 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0467419  normal  0.85773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 
571 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  42.58 
 
 
754 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.1 
 
 
673 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.75 
 
 
814 aa  190  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  46.09 
 
 
617 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4679  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
590 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  46.43 
 
 
616 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3842  serine/threonine protein kinase  39.6 
 
 
357 aa  188  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.276356  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3365  protein kinase  41.36 
 
 
545 aa  188  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.04 
 
 
600 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  43.73 
 
 
481 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
611 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.85 
 
 
865 aa  187  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  44.13 
 
 
520 aa  186  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 
292 aa  186  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  47.24 
 
 
676 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2849  serine/threonine protein kinase  45.06 
 
 
709 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.94 
 
 
481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  46.46 
 
 
624 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.99 
 
 
751 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.75 
 
 
496 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>