More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6771 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 
737 aa  1439    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.37 
 
 
716 aa  611  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  42.03 
 
 
675 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.91 
 
 
740 aa  317  7e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.71 
 
 
642 aa  312  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  59.39 
 
 
518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  52.81 
 
 
863 aa  302  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  52.11 
 
 
1344 aa  303  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  53.61 
 
 
652 aa  298  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  53.33 
 
 
892 aa  297  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  54.26 
 
 
919 aa  290  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  54.11 
 
 
1357 aa  287  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  47.24 
 
 
405 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  61.59 
 
 
772 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0242  serine/threonine protein kinase  61.6 
 
 
295 aa  277  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.49 
 
 
682 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  55.21 
 
 
719 aa  275  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.54 
 
 
1240 aa  271  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.45 
 
 
1557 aa  268  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  41.19 
 
 
461 aa  266  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  47.27 
 
 
1221 aa  260  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  53.82 
 
 
807 aa  259  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  52.56 
 
 
1217 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.57 
 
 
1262 aa  253  9.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  50.42 
 
 
540 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  42.9 
 
 
1363 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  50.32 
 
 
696 aa  246  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.71 
 
 
664 aa  243  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  42.04 
 
 
1789 aa  241  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  45.45 
 
 
1364 aa  239  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40.44 
 
 
1652 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  44.81 
 
 
1163 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.44 
 
 
865 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  44.92 
 
 
1553 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4910  serine/threonine protein kinase  43.68 
 
 
552 aa  238  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104206  decreased coverage  0.00224255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 
687 aa  232  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  50.66 
 
 
770 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  43.23 
 
 
1188 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.97 
 
 
833 aa  226  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  54.29 
 
 
756 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  43.23 
 
 
1334 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  42.02 
 
 
947 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  45.51 
 
 
1510 aa  224  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.21 
 
 
676 aa  223  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40 
 
 
630 aa  223  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.55 
 
 
1481 aa  222  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.72 
 
 
828 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  37.64 
 
 
1552 aa  221  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  40.66 
 
 
1474 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  43.32 
 
 
1236 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  43.59 
 
 
1190 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  42.44 
 
 
1599 aa  217  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.13 
 
 
930 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  44.34 
 
 
1211 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  43.55 
 
 
1523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  49.34 
 
 
732 aa  214  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.88 
 
 
1242 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  42.39 
 
 
1878 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  37.96 
 
 
1196 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.88 
 
 
1686 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  42.41 
 
 
1661 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  46.84 
 
 
344 aa  208  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  37.07 
 
 
1193 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  43.45 
 
 
1443 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  43.59 
 
 
924 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.5 
 
 
1711 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  39.1 
 
 
1657 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.33 
 
 
677 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  45.11 
 
 
344 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  42.21 
 
 
1176 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  41.04 
 
 
434 aa  197  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.96 
 
 
733 aa  197  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  36.66 
 
 
1247 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  41.69 
 
 
1714 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.61 
 
 
576 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.99 
 
 
1267 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.59 
 
 
806 aa  195  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  45.85 
 
 
742 aa  194  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.42 
 
 
682 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.53 
 
 
692 aa  194  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  41.29 
 
 
1454 aa  193  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  39.81 
 
 
1177 aa  193  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  35.81 
 
 
1411 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  35.18 
 
 
692 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  42.11 
 
 
1656 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  31.91 
 
 
1213 aa  187  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  38.69 
 
 
1229 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  43.27 
 
 
850 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  45.24 
 
 
790 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  34.64 
 
 
657 aa  185  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  38.06 
 
 
317 aa  185  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.01 
 
 
622 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 
691 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  42.04 
 
 
577 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  35.33 
 
 
1491 aa  182  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.3 
 
 
1609 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  34.5 
 
 
1858 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  37.13 
 
 
1807 aa  181  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  36.55 
 
 
1399 aa  181  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  37.46 
 
 
335 aa  181  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>