More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3773 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 405 aa  788    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  54.66 
 
 		 716 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  47.03 
 
 		 737 aa  282  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  47.78 
 
 		 919 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  47.01 
 
 		 1344 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  52.22 
 
 		 675 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.17 
 
 		 682 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  45.45 
 
 		 1357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.81 
 
 		 1240 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.63 
 
 		 1557 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40.06 
 
 		 1652 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  45.91 
 
 		 652 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.26 
 
 		 865 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.06 
 
 		 833 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  39.12 
 
 		 1363 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.13 
 
 		 1481 aa  216  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  44.68 
 
 		 540 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.9 
 
 		 828 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  40.51 
 
 		 1553 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  37.69 
 
 		 1789 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  37.18 
 
 		 1599 aa  209  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  39.88 
 
 		 1163 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  39.51 
 
 		 696 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  40.69 
 
 		 1510 aa  207  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  39.82 
 
 		 1334 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  43.25 
 
 		 461 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  36.84 
 
 		 1364 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  37.62 
 
 		 947 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 1221 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  38.69 
 
 		 1211 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  40.13 
 
 		 1523 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.53 
 
 		 740 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  36.8 
 
 		 1196 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  40.94 
 
 		 344 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  40.87 
 
 		 1217 aa  193  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  36.76 
 
 		 1552 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  40.31 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  42.9 
 
 		 924 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.07 
 
 		 676 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  41.51 
 
 		 1443 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  38.01 
 
 		 1878 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.38 
 
 		 1686 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  36.56 
 
 		 1190 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.03 
 
 		 1711 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.04 
 
 		 682 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  41.07 
 
 		 1831 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  32.01 
 
 		 1858 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  35.65 
 
 		 1236 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.71 
 
 		 1267 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  35.65 
 
 		 1193 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  33.8 
 
 		 1656 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  35.96 
 
 		 335 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31.13 
 
 		 1247 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  36.48 
 
 		 1177 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  35.31 
 
 		 1474 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  31.04 
 
 		 657 aa  176  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  36 
 
 		 434 aa  176  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  33.54 
 
 		 1367 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.01 
 
 		 576 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.74 
 
 		 630 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.66 
 
 		 677 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  33.64 
 
 		 1188 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  36.8 
 
 		 1183 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  35.78 
 
 		 1229 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1657 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  33.95 
 
 		 1188 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  34.81 
 
 		 742 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  36.31 
 
 		 1661 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.21 
 
 		 1760 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  33.74 
 
 		 1714 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  31.04 
 
 		 1213 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.96 
 
 		 930 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  35.83 
 
 		 1176 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.24 
 
 		 664 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  36.59 
 
 		 1491 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.65 
 
 		 1583 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.94 
 
 		 692 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.54 
 
 		 757 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  38.1 
 
 		 790 aa  162  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  36.97 
 
 		 1041 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  33.02 
 
 		 1161 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  33.02 
 
 		 1161 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.02 
 
 		 1348 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.69 
 
 		 1609 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.05 
 
 		 1623 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.36 
 
 		 1599 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.07 
 
 		 1398 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  35.14 
 
 		 1454 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.57 
 
 		 1684 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  33.23 
 
 		 1416 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.33 
 
 		 1547 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  32.76 
 
 		 317 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.24 
 
 		 642 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  29.9 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 687 aa  152  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  38.9 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.15 
 
 		 1004 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  34.91 
 
 		 1807 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.17 
 
 		 608 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  31.31 
 
 		 1190 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>