More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2184 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 1240 aa  2543    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.92 
 
 		 1481 aa  764    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  39.46 
 
 		 1553 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  39.59 
 
 		 1510 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.04 
 
 		 1711 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  77.68 
 
 		 1557 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.02 
 
 		 1686 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  37.5 
 
 		 1357 aa  511  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.31 
 
 		 1760 aa  503  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.75 
 
 		 1598 aa  502  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.14 
 
 		 1398 aa  475  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.65 
 
 		 1583 aa  462  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.05 
 
 		 1626 aa  462  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.85 
 
 		 1547 aa  449  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.79 
 
 		 1684 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  33.86 
 
 		 1236 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  32.88 
 
 		 1344 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.94 
 
 		 1623 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.87 
 
 		 1617 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.42 
 
 		 1599 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 1334 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1657 aa  358  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  34.39 
 
 		 902 aa  348  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  49.14 
 
 		 919 aa  340  8e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  44.58 
 
 		 1789 aa  340  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  52.74 
 
 		 1367 aa  336  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  52.15 
 
 		 1211 aa  333  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  42.6 
 
 		 1652 aa  319  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  39.38 
 
 		 1363 aa  317  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  30.06 
 
 		 1733 aa  313  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  28.11 
 
 		 1265 aa  312  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  49.26 
 
 		 1267 aa  310  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27 
 
 		 1823 aa  307  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.09 
 
 		 1190 aa  304  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.16 
 
 		 1607 aa  304  9e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.13 
 
 		 1609 aa  303  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  43.87 
 
 		 1163 aa  301  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  46.79 
 
 		 1523 aa  301  7e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  39.64 
 
 		 1599 aa  298  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  44.35 
 
 		 1552 aa  298  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  28.97 
 
 		 901 aa  297  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  44.61 
 
 		 1364 aa  292  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  42.48 
 
 		 1868 aa  292  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  37.48 
 
 		 1656 aa  290  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1491 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 1221 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  47.06 
 
 		 1217 aa  284  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  50.34 
 
 		 675 aa  280  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  41.85 
 
 		 947 aa  279  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  43.62 
 
 		 696 aa  275  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  46.32 
 
 		 1454 aa  275  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.2 
 
 		 716 aa  275  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1399 aa  273  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.54 
 
 		 737 aa  271  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  39.16 
 
 		 1196 aa  269  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.29 
 
 		 740 aa  269  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  43.81 
 
 		 1443 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  42.22 
 
 		 1247 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  29 
 
 		 1699 aa  263  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  42.55 
 
 		 1416 aa  260  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  42.58 
 
 		 1661 aa  260  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  45.05 
 
 		 652 aa  259  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  32.95 
 
 		 1161 aa  259  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  32.95 
 
 		 1161 aa  258  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.91 
 
 		 930 aa  257  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  40.73 
 
 		 1193 aa  255  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1026 aa  252  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  38.58 
 
 		 1188 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  40.67 
 
 		 1474 aa  251  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  35.19 
 
 		 1176 aa  250  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  34.43 
 
 		 1152 aa  249  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  38.28 
 
 		 1190 aa  245  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  37.07 
 
 		 1858 aa  245  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  42.11 
 
 		 1229 aa  244  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.91 
 
 		 676 aa  242  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  33.9 
 
 		 1157 aa  242  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  39.65 
 
 		 657 aa  240  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  34.53 
 
 		 1164 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  39.33 
 
 		 344 aa  240  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  42.4 
 
 		 1714 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  38.14 
 
 		 1177 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  44.56 
 
 		 434 aa  236  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  39.81 
 
 		 405 aa  234  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.07 
 
 		 677 aa  234  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  35.08 
 
 		 505 aa  232  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  40.36 
 
 		 924 aa  233  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.74 
 
 		 682 aa  232  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1355 aa  231  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  39.33 
 
 		 344 aa  231  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  36.09 
 
 		 728 aa  231  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  32.94 
 
 		 1348 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  38.96 
 
 		 1766 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  37.32 
 
 		 1213 aa  228  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  39.31 
 
 		 1411 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.45 
 
 		 692 aa  226  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.29 
 
 		 1262 aa  225  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1230 aa  224  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  47.96 
 
 		 540 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.43 
 
 		 576 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  35.41 
 
 		 1209 aa  222  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>