More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3910 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  79.43 
 
 		 1157 aa  1791    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 1152 aa  2278    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.71 
 
 		 1711 aa  323  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.44 
 
 		 1481 aa  305  4.0000000000000003e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.8 
 
 		 1760 aa  302  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.06 
 
 		 1240 aa  298  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 1334 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.08 
 
 		 1598 aa  246  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.14 
 
 		 1236 aa  243  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 		 1078 aa  231  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 		 972 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  36.83 
 
 		 1265 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.64 
 
 		 1686 aa  224  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  34.03 
 
 		 1553 aa  223  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  36.18 
 
 		 973 aa  219  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  32.27 
 
 		 1510 aa  216  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  36.34 
 
 		 969 aa  214  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  36.34 
 
 		 969 aa  213  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  35.64 
 
 		 1344 aa  212  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  34.16 
 
 		 902 aa  212  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1026 aa  212  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.35 
 
 		 1626 aa  211  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1230 aa  207  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.38 
 
 		 1599 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  36.67 
 
 		 1733 aa  204  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.07 
 
 		 1623 aa  202  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  35.87 
 
 		 965 aa  202  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  32.17 
 
 		 1308 aa  202  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  34.32 
 
 		 1657 aa  201  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 		 897 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 1013 aa  199  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.75 
 
 		 1190 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1073 aa  195  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 		 1353 aa  195  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  35.99 
 
 		 885 aa  194  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.73 
 
 		 1547 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.2 
 
 		 1607 aa  184  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.94 
 
 		 1617 aa  184  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 		 1032 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  32.3 
 
 		 901 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.71 
 
 		 1823 aa  180  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.26 
 
 		 1583 aa  180  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.9 
 
 		 1609 aa  179  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.02 
 
 		 1398 aa  178  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1399 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 		 1014 aa  166  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.38 
 
 		 1684 aa  165  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 		 1005 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 		 1046 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.48 
 
 		 1357 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 		 1020 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1432 aa  148  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 		 1085 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  34.02 
 
 		 1194 aa  144  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.69 
 
 		 1217 aa  144  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.05 
 
 		 1267 aa  141  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  27.55 
 
 		 1124 aa  140  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  36.34 
 
 		 1314 aa  139  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 		 947 aa  138  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  26.12 
 
 		 1301 aa  136  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1491 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.87 
 
 		 924 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.74 
 
 		 1831 aa  128  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.15 
 
 		 505 aa  128  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.03 
 
 		 919 aa  127  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1392 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.33 
 
 		 1856 aa  126  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1401 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1229 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.04 
 
 		 1557 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.08 
 
 		 1363 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.18 
 
 		 676 aa  121  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  27.63 
 
 		 774 aa  117  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.17 
 
 		 1807 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  29.71 
 
 		 1766 aa  117  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1552 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.53 
 
 		 833 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  29 
 
 		 1075 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.65 
 
 		 1188 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  29 
 
 		 1080 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.47 
 
 		 1163 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  28.54 
 
 		 1075 aa  115  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  28.77 
 
 		 1063 aa  115  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.92 
 
 		 589 aa  114  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  29.38 
 
 		 1193 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.91 
 
 		 1652 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  28.78 
 
 		 1190 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.3 
 
 		 1213 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  27.49 
 
 		 778 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1477 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 1190 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  27.59 
 
 		 1102 aa  111  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.43 
 
 		 865 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1211 aa  110  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1196 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  31.31 
 
 		 1355 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1304 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  28.38 
 
 		 1092 aa  109  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  26.1 
 
 		 1280 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.85 
 
 		 1443 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>