More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3275 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  53.3 
 
 
1557 aa  1395    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
1474 aa  3044    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  51.76 
 
 
1443 aa  1507    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  46.45 
 
 
1221 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  41.41 
 
 
1188 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  43.45 
 
 
1196 aa  580  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  41.47 
 
 
1193 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  40.11 
 
 
1190 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  44.46 
 
 
1652 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  40.61 
 
 
1163 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  43.45 
 
 
696 aa  505  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  42.93 
 
 
1363 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.35 
 
 
1831 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  44.13 
 
 
947 aa  500  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  37.27 
 
 
1247 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  37.61 
 
 
1523 aa  489  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  35.98 
 
 
1213 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.64 
 
 
1868 aa  486  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  46.07 
 
 
1364 aa  476  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  41.9 
 
 
1236 aa  476  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  37.13 
 
 
1208 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  37.67 
 
 
1454 aa  440  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  39.23 
 
 
1789 aa  422  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  39 
 
 
1510 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  39.09 
 
 
1357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  31.14 
 
 
1188 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.52 
 
 
1481 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.46 
 
 
1686 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.81 
 
 
1711 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  38.49 
 
 
1553 aa  393  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  38.96 
 
 
919 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.9 
 
 
1901 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  38.58 
 
 
1217 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  37.86 
 
 
1211 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.08 
 
 
1760 aa  364  7.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  33.24 
 
 
1411 aa  363  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.06 
 
 
1262 aa  359  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  37.89 
 
 
1714 aa  359  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  35.27 
 
 
1229 aa  357  7.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  39.18 
 
 
1656 aa  357  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.92 
 
 
1599 aa  355  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.56 
 
 
930 aa  354  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.81 
 
 
1807 aa  349  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  37.31 
 
 
1661 aa  347  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  33.51 
 
 
1552 aa  345  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 
1367 aa  343  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 
1607 aa  342  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.19 
 
 
1598 aa  341  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.55 
 
 
1609 aa  340  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.69 
 
 
1348 aa  335  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.47 
 
 
1583 aa  328  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.52 
 
 
1684 aa  328  7e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.22 
 
 
1547 aa  325  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  32.49 
 
 
1858 aa  318  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  31.6 
 
 
1416 aa  317  9e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  34.42 
 
 
728 aa  315  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.84 
 
 
1626 aa  313  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  31.75 
 
 
1242 aa  310  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  32.76 
 
 
1161 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  32.82 
 
 
1161 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.54 
 
 
1617 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  32.12 
 
 
1280 aa  310  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  35.29 
 
 
1176 aa  308  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.61 
 
 
1766 aa  307  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  33.03 
 
 
1177 aa  294  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  30.41 
 
 
1164 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  28.62 
 
 
1214 aa  286  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  26.76 
 
 
1209 aa  285  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  29.45 
 
 
1330 aa  283  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.26 
 
 
1856 aa  281  6e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.84 
 
 
1823 aa  279  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.18 
 
 
1267 aa  277  9e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  38.61 
 
 
1599 aa  275  7e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.17 
 
 
1623 aa  274  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31 
 
 
1304 aa  271  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.97 
 
 
924 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  29.75 
 
 
505 aa  264  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.55 
 
 
740 aa  263  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  36.49 
 
 
1878 aa  263  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  31.13 
 
 
608 aa  260  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  39.82 
 
 
344 aa  261  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  29.54 
 
 
1344 aa  258  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  39.82 
 
 
344 aa  258  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  29.2 
 
 
1209 aa  257  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  29.15 
 
 
1016 aa  256  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  29.15 
 
 
1016 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.33 
 
 
676 aa  254  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 
1311 aa  253  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  30.02 
 
 
1264 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  30.02 
 
 
1264 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.67 
 
 
1240 aa  251  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  27.95 
 
 
1484 aa  250  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  31.8 
 
 
1373 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.43 
 
 
1205 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.61 
 
 
664 aa  243  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  28.12 
 
 
1399 aa  243  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  43.37 
 
 
742 aa  243  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.26 
 
 
1039 aa  241  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  41.4 
 
 
434 aa  238  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.78 
 
 
677 aa  238  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>