More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1213 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  100 
 
 		 1416 aa  2831    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  39.92 
 
 		 1523 aa  460  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  34.86 
 
 		 728 aa  416  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.68 
 
 		 1652 aa  406  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  40.1 
 
 		 1454 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  35.01 
 
 		 1363 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  36.32 
 
 		 1236 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.58 
 
 		 1557 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  34.76 
 
 		 1163 aa  365  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  39.02 
 
 		 696 aa  363  9e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  36.73 
 
 		 1364 aa  361  5e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.41 
 
 		 1481 aa  359  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  33.39 
 
 		 947 aa  355  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  37.28 
 
 		 1510 aa  353  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  37.01 
 
 		 1553 aa  352  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.45 
 
 		 1868 aa  350  9e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.6 
 
 		 1686 aa  349  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  34.82 
 
 		 1831 aa  346  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  32.9 
 
 		 1280 aa  345  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.88 
 
 		 1196 aa  342  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  36.38 
 
 		 1789 aa  340  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  34.8 
 
 		 1367 aa  340  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 1221 aa  336  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.79 
 
 		 1626 aa  332  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.41 
 
 		 1583 aa  330  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.15 
 
 		 1598 aa  329  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.25 
 
 		 1609 aa  328  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.04 
 
 		 1262 aa  326  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  31.6 
 
 		 1474 aa  317  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.16 
 
 		 1607 aa  315  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  36.62 
 
 		 505 aa  314  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.01 
 
 		 1547 aa  313  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.95 
 
 		 1484 aa  312  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  33.77 
 
 		 1193 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  34.74 
 
 		 1443 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.77 
 
 		 1623 aa  307  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.98 
 
 		 1213 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  36.39 
 
 		 1357 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  35.97 
 
 		 1211 aa  303  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  33.1 
 
 		 1552 aa  303  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  33.22 
 
 		 1190 aa  298  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.73 
 
 		 1617 aa  298  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.72 
 
 		 1711 aa  297  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.1 
 
 		 919 aa  296  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  34.75 
 
 		 1656 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  31.38 
 
 		 1229 aa  292  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  32.42 
 
 		 1247 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.97 
 
 		 1188 aa  290  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.53 
 
 		 1267 aa  286  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.95 
 
 		 930 aa  286  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.57 
 
 		 1684 aa  285  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.75 
 
 		 1599 aa  276  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  37.61 
 
 		 1217 aa  275  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  35.31 
 
 		 1766 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.19 
 
 		 1901 aa  271  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  31.48 
 
 		 1348 aa  267  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1491 aa  266  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 1760 aa  262  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.94 
 
 		 1240 aa  260  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  30.44 
 
 		 1161 aa  258  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  32.07 
 
 		 1661 aa  258  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.28 
 
 		 1161 aa  258  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  32.33 
 
 		 1714 aa  258  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.35 
 
 		 1807 aa  256  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.48 
 
 		 1398 aa  252  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.85 
 
 		 1188 aa  249  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.48 
 
 		 1242 aa  242  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1176 aa  240  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.45 
 
 		 677 aa  237  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.13 
 
 		 1208 aa  237  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1858 aa  236  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.66 
 
 		 924 aa  233  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  28.27 
 
 		 1311 aa  231  9e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  29.97 
 
 		 1177 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.8 
 
 		 1856 aa  228  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.58 
 
 		 682 aa  226  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.79 
 
 		 1164 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.86 
 
 		 676 aa  221  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  33.09 
 
 		 1100 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1427 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  43.94 
 
 		 742 aa  219  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  33.68 
 
 		 1344 aa  218  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  26.91 
 
 		 1330 aa  217  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.18 
 
 		 1823 aa  217  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  36.44 
 
 		 1599 aa  216  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.07 
 
 		 1214 aa  216  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.89 
 
 		 740 aa  213  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  34.24 
 
 		 1878 aa  211  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  33.07 
 
 		 434 aa  207  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.02 
 
 		 576 aa  207  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  28.38 
 
 		 1016 aa  207  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.84 
 
 		 1072 aa  206  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  28.28 
 
 		 1016 aa  204  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  34.51 
 
 		 657 aa  204  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.16 
 
 		 1072 aa  204  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.16 
 
 		 1373 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.31 
 
 		 1205 aa  203  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.1 
 
 		 630 aa  202  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  36.65 
 
 		 316 aa  202  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  36.78 
 
 		 344 aa  202  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>