More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4185 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 719 aa  1379    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  43.58 
 
 		 732 aa  419  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.8 
 
 		 737 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  52 
 
 		 863 aa  293  8e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  52.68 
 
 		 892 aa  286  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  56.41 
 
 		 807 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  55.21 
 
 		 518 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  55.12 
 
 		 770 aa  266  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  50.71 
 
 		 716 aa  260  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4910  serine/threonine protein kinase  44.85 
 
 		 552 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104206  decreased coverage  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  53.33 
 
 		 772 aa  237  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  51.16 
 
 		 682 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0242  serine/threonine protein kinase  52.33 
 
 		 295 aa  212  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  50.18 
 
 		 756 aa  207  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1030 aa  180  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.93 
 
 		 641 aa  173  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 		 520 aa  173  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1995  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.96 
 
 		 682 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  41.92 
 
 		 612 aa  171  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  38.24 
 
 		 1018 aa  171  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  41.07 
 
 		 951 aa  171  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  41.7 
 
 		 572 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  39.48 
 
 		 583 aa  168  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  43.35 
 
 		 593 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1202  serine/threonine protein kinase  39.63 
 
 		 655 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.96 
 
 		 602 aa  167  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.85 
 
 		 584 aa  167  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  36.05 
 
 		 692 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 		 850 aa  164  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  34.84 
 
 		 1750 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  38.73 
 
 		 1053 aa  163  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 		 985 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 		 691 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  38.02 
 
 		 621 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.85 
 
 		 632 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  38.77 
 
 		 1057 aa  161  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.7 
 
 		 681 aa  160  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3845  protein kinase  42.65 
 
 		 531 aa  160  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111657  hitchhiker  0.000135014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  37.72 
 
 		 586 aa  160  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 		 600 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.02 
 
 		 579 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.44 
 
 		 715 aa  159  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  39.77 
 
 		 1032 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 		 691 aa  158  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.23 
 
 		 598 aa  158  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  41.47 
 
 		 666 aa  158  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  39.77 
 
 		 1032 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.02 
 
 		 591 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.8 
 
 		 664 aa  157  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.04 
 
 		 499 aa  157  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  38.13 
 
 		 703 aa  157  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 		 628 aa  157  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 		 468 aa  157  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 		 746 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  44.83 
 
 		 468 aa  156  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.3 
 
 		 505 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.03 
 
 		 693 aa  156  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.26 
 
 		 668 aa  156  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  40.55 
 
 		 763 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  40.54 
 
 		 758 aa  156  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  38.75 
 
 		 907 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 		 596 aa  155  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 		 776 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  39.78 
 
 		 661 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.25 
 
 		 916 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.21 
 
 		 843 aa  154  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  39.48 
 
 		 1398 aa  154  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  32.49 
 
 		 1351 aa  154  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1104  serine/threonine protein kinase  41.76 
 
 		 607 aa  154  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.511251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.37 
 
 		 603 aa  153  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  36.46 
 
 		 620 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 		 673 aa  153  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 		 585 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 		 700 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3623  serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 		 715 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.569481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  36.53 
 
 		 618 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.35 
 
 		 658 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  36.9 
 
 		 667 aa  151  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  40.32 
 
 		 503 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  35.97 
 
 		 612 aa  152  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 		 568 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4009  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.66 
 
 		 459 aa  151  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.56 
 
 		 601 aa  151  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 		 632 aa  151  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 		 651 aa  151  5e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  38.66 
 
 		 543 aa  151  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  38.08 
 
 		 625 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.23 
 
 		 562 aa  150  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.65 
 
 		 620 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.08 
 
 		 676 aa  150  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  39.46 
 
 		 559 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.82 
 
 		 863 aa  150  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 		 642 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  37.77 
 
 		 618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.62 
 
 		 614 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.61 
 
 		 661 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 		 614 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.13 
 
 		 551 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  35.94 
 
 		 617 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>