More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3623 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3623  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
715 aa  1403    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.569481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1111  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  75.93 
 
 
741 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621151  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0097  serine/threonine protein kinase  47.49 
 
 
675 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255203  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1403  serine/threonine protein kinase  43.51 
 
 
642 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1404  serine/threonine protein kinase  46.13 
 
 
716 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  34.02 
 
 
662 aa  169  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.18 
 
 
584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.36 
 
 
650 aa  165  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
691 aa  164  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.95 
 
 
602 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1995  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.07 
 
 
682 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215989  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
517 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  30.86 
 
 
692 aa  161  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  42.6 
 
 
518 aa  160  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.08 
 
 
632 aa  159  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  41.06 
 
 
763 aa  158  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 
513 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.83 
 
 
627 aa  157  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  40.47 
 
 
497 aa  157  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.45 
 
 
676 aa  157  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
503 aa  157  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.1 
 
 
880 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  35.07 
 
 
625 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.08 
 
 
614 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
703 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  32.2 
 
 
621 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  30.16 
 
 
634 aa  155  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
513 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  37.1 
 
 
661 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 
559 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 
568 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 
700 aa  154  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.32 
 
 
627 aa  154  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  35.21 
 
 
776 aa  153  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  38.76 
 
 
484 aa  153  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.02 
 
 
737 aa  154  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
625 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  38.15 
 
 
580 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  40.29 
 
 
572 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 
600 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.03 
 
 
681 aa  152  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.64 
 
 
668 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 
612 aa  152  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.47 
 
 
598 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  37.82 
 
 
626 aa  152  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.16 
 
 
700 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  37.18 
 
 
618 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4435  serine/threonine protein kinase  37.32 
 
 
542 aa  151  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
700 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 
863 aa  151  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  35.66 
 
 
519 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 
624 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.73 
 
 
647 aa  150  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 
624 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 
624 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  36.64 
 
 
1104 aa  150  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  39.08 
 
 
480 aa  150  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1794  serine/threonine protein kinase  37.67 
 
 
416 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.08 
 
 
562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.81 
 
 
681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.32 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
673 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
422 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  37.23 
 
 
668 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
450 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 
636 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 
612 aa  148  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  41.48 
 
 
951 aa  148  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
611 aa  148  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
604 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
625 aa  147  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
382 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.9 
 
 
693 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  37.3 
 
 
586 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
651 aa  147  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.5 
 
 
518 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7672  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.04 
 
 
650 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  34.74 
 
 
632 aa  147  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.22 
 
 
620 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  36.6 
 
 
626 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  38.91 
 
 
522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.52 
 
 
505 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 
450 aa  147  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
615 aa  147  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
691 aa  146  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3400  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
522 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.06 
 
 
1044 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3463  protein kinase  39.02 
 
 
522 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0363324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3411  protein kinase  39.02 
 
 
522 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  36.46 
 
 
625 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.23 
 
 
445 aa  146  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.21 
 
 
593 aa  147  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.66 
 
 
967 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 
528 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  35.19 
 
 
1057 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4569  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.1 
 
 
655 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.967984  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
552 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  34.52 
 
 
604 aa  145  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.61 
 
 
664 aa  145  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.93 
 
 
601 aa  145  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>