More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3106 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  100 
 
 
518 aa  1032    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  54.26 
 
 
659 aa  299  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  43.99 
 
 
527 aa  293  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  52.96 
 
 
574 aa  286  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  50 
 
 
586 aa  286  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  45.76 
 
 
583 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  54.41 
 
 
561 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  52.63 
 
 
626 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  55.04 
 
 
484 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3400  serine/threonine protein kinase  57.25 
 
 
522 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3463  protein kinase  57.25 
 
 
522 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0363324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3411  protein kinase  57.25 
 
 
522 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  49.52 
 
 
1358 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1066  protein kinase  52.8 
 
 
486 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  55.94 
 
 
530 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  42.86 
 
 
664 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  54.86 
 
 
622 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  52.94 
 
 
604 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  45.24 
 
 
566 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  55.08 
 
 
1108 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 
776 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  48.35 
 
 
541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  45.29 
 
 
519 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 
776 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  42.21 
 
 
863 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  39.94 
 
 
671 aa  213  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  39.56 
 
 
444 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  41 
 
 
673 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  41.77 
 
 
618 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  41.97 
 
 
571 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  40.8 
 
 
612 aa  207  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  43.64 
 
 
349 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.45 
 
 
880 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  41.61 
 
 
599 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.38 
 
 
916 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  37.53 
 
 
587 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  37.53 
 
 
587 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  37.53 
 
 
587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40 
 
 
518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  42.05 
 
 
615 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  42.2 
 
 
618 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  41.76 
 
 
569 aa  196  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  36.95 
 
 
513 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  41.83 
 
 
568 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.63 
 
 
658 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.86 
 
 
681 aa  194  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  41.06 
 
 
468 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.76 
 
 
627 aa  193  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.35 
 
 
602 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.16 
 
 
647 aa  190  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.14 
 
 
438 aa  190  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
585 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 
641 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.39 
 
 
511 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
763 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  39.51 
 
 
661 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  42.28 
 
 
519 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  35.51 
 
 
668 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00370  serine/threonine protein kinase  38.9 
 
 
419 aa  187  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.339035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.38 
 
 
676 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 
585 aa  187  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 
468 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
612 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  33.18 
 
 
889 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.91 
 
 
603 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  42.54 
 
 
533 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.63 
 
 
551 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 
497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  42.07 
 
 
559 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  39.55 
 
 
589 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
690 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.93 
 
 
668 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  39.7 
 
 
758 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  36.86 
 
 
621 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  40.89 
 
 
646 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.08 
 
 
613 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 
503 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.53 
 
 
499 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.39 
 
 
664 aa  183  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 
581 aa  183  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 
382 aa  183  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  40.49 
 
 
598 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  44.79 
 
 
469 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.04 
 
 
641 aa  182  9.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  38.41 
 
 
487 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  37.59 
 
 
634 aa  182  9.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.21 
 
 
598 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  39.34 
 
 
597 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  38.97 
 
 
586 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  44.02 
 
 
377 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 
661 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 
480 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  38.18 
 
 
609 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  39.24 
 
 
554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  35.62 
 
 
736 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  38.75 
 
 
700 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 
707 aa  181  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  36.43 
 
 
667 aa  181  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>