More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1342 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  100 
 
 
528 aa  1046    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  48.68 
 
 
557 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  46.2 
 
 
757 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5621  serine/threonine protein kinase  48.04 
 
 
845 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205775  normal  0.427226 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.24 
 
 
598 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  41.72 
 
 
612 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5424  serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 
518 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178925  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2732  serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 
563 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.420393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  43.19 
 
 
646 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.27 
 
 
642 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  38.41 
 
 
638 aa  203  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.88 
 
 
650 aa  203  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.65 
 
 
740 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  41.73 
 
 
625 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 
531 aa  199  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3142  serine/threonine protein kinase  36.68 
 
 
499 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0617984  normal  0.649612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  45.15 
 
 
599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.43 
 
 
662 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  43.12 
 
 
593 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  42.96 
 
 
666 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  43.87 
 
 
642 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.56 
 
 
676 aa  194  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.25 
 
 
667 aa  193  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  46.44 
 
 
522 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40.82 
 
 
1044 aa  192  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4569  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40.37 
 
 
655 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.967984  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.86 
 
 
591 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  44.09 
 
 
646 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  43.53 
 
 
468 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 
612 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  34.54 
 
 
692 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.91 
 
 
584 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  38.57 
 
 
621 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  44.29 
 
 
498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.5 
 
 
647 aa  190  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  44.61 
 
 
480 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.11 
 
 
641 aa  190  5.999999999999999e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 
691 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.58 
 
 
603 aa  190  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  45.99 
 
 
763 aa  190  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.12 
 
 
645 aa  189  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  40.38 
 
 
651 aa  189  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  41.28 
 
 
668 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 
746 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.79 
 
 
602 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.38 
 
 
520 aa  188  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.21 
 
 
652 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  41.89 
 
 
776 aa  188  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  39.3 
 
 
692 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  41.89 
 
 
457 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.31 
 
 
579 aa  187  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  43.56 
 
 
568 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.46 
 
 
693 aa  186  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.28 
 
 
718 aa  186  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.75 
 
 
658 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.72 
 
 
607 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.38 
 
 
664 aa  186  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2518  serine/threonine protein kinase  36.61 
 
 
505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1514  serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 
505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  44.36 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  42.15 
 
 
502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  44.28 
 
 
559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0957  serine/threonine protein kinase  35.7 
 
 
523 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  35.84 
 
 
761 aa  184  3e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.88 
 
 
614 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
673 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  38.29 
 
 
703 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.67 
 
 
696 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  41.64 
 
 
658 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  42.59 
 
 
758 aa  184  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.59 
 
 
681 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.12 
 
 
620 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.66 
 
 
632 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  41.55 
 
 
609 aa  183  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.27 
 
 
681 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  42.34 
 
 
382 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.55 
 
 
601 aa  182  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  45.56 
 
 
499 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.52 
 
 
553 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  38.33 
 
 
1479 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  43.33 
 
 
585 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  40.78 
 
 
691 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  41.91 
 
 
636 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 
723 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  41.16 
 
 
691 aa  181  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.13 
 
 
668 aa  181  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  42.48 
 
 
1104 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  42.28 
 
 
465 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  40.61 
 
 
611 aa  180  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.5 
 
 
406 aa  180  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.85 
 
 
707 aa  180  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 
597 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  40.34 
 
 
596 aa  179  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 
601 aa  179  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  39.41 
 
 
672 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
700 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  41.52 
 
 
632 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.6 
 
 
666 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  41.48 
 
 
1053 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  42.55 
 
 
654 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>