More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1111 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1111  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  100 
 
 
741 aa  1458    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621151  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3623  serine/threonine protein kinase  75.46 
 
 
715 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.569481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0097  serine/threonine protein kinase  46.92 
 
 
675 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255203  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1404  serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 
716 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1403  serine/threonine protein kinase  44.11 
 
 
642 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 
625 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.75 
 
 
602 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  40.52 
 
 
517 aa  163  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  41.02 
 
 
450 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.83 
 
 
584 aa  159  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 
513 aa  158  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
691 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  36.5 
 
 
700 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.58 
 
 
967 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 
614 aa  155  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  38.43 
 
 
783 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  37.22 
 
 
497 aa  154  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.35 
 
 
1044 aa  154  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.82 
 
 
647 aa  154  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1995  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.37 
 
 
682 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215989  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 
1104 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  31.5 
 
 
692 aa  152  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  31.67 
 
 
662 aa  151  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  38.3 
 
 
668 aa  151  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.08 
 
 
598 aa  151  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  36.23 
 
 
519 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.05 
 
 
664 aa  150  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 
625 aa  150  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  41.81 
 
 
518 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  38.03 
 
 
951 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 
612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  36.19 
 
 
1053 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.23 
 
 
681 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.83 
 
 
676 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.85 
 
 
627 aa  148  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.46 
 
 
632 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.53 
 
 
740 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  35.34 
 
 
661 aa  147  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
636 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  31.02 
 
 
634 aa  147  9e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  36.98 
 
 
484 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  36.26 
 
 
626 aa  147  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
590 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
651 aa  145  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0115  serine/threonine protein kinase  35.36 
 
 
588 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.03 
 
 
681 aa  146  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  37.45 
 
 
574 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.5 
 
 
661 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  40.75 
 
 
572 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0122  serine/threonine protein kinase  33.95 
 
 
592 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
450 aa  145  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.63 
 
 
499 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  35.87 
 
 
559 aa  145  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  38.15 
 
 
513 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  35.56 
 
 
615 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
580 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6420  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
511 aa  144  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.25 
 
 
614 aa  144  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.69 
 
 
607 aa  143  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  34.7 
 
 
568 aa  143  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 
776 aa  143  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  36.88 
 
 
498 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  36.55 
 
 
658 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.08 
 
 
627 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  30.45 
 
 
796 aa  143  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.8 
 
 
668 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
691 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 
624 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  31.39 
 
 
667 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.1 
 
 
603 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
632 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 
624 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2182  Serine/threonine protein kinase-related protein  35 
 
 
1060 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
703 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 
624 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.1 
 
 
652 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 
757 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  35.56 
 
 
1057 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3381  serine/threonine protein kinase  38.96 
 
 
289 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.4 
 
 
700 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7672  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.8 
 
 
650 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
626 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0993188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 
604 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 
612 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.69 
 
 
562 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  33.82 
 
 
625 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  35.34 
 
 
604 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  37.16 
 
 
468 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.13 
 
 
737 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  34.33 
 
 
593 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.12 
 
 
579 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  36.53 
 
 
618 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.55 
 
 
696 aa  141  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  35.02 
 
 
625 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
615 aa  140  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4569  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.95 
 
 
655 aa  141  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.967984  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  35.41 
 
 
477 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  36.51 
 
 
586 aa  140  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>