More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2500 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1351 aa  2753    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  60.26 
 
 		 1030 aa  403  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  50.3 
 
 		 850 aa  296  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  51.23 
 
 		 1750 aa  295  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  45.43 
 
 		 1763 aa  259  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  44.41 
 
 		 772 aa  248  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  46.56 
 
 		 892 aa  244  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  41.6 
 
 		 1051 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1052 aa  235  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  45.92 
 
 		 623 aa  220  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  39.45 
 
 		 2296 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  39.94 
 
 		 646 aa  208  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  42.91 
 
 		 2831 aa  206  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  37.39 
 
 		 439 aa  204  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  43.16 
 
 		 863 aa  184  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  35.24 
 
 		 963 aa  181  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  43.27 
 
 		 2961 aa  166  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  34.6 
 
 		 425 aa  166  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  40.48 
 
 		 1046 aa  166  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  35.38 
 
 		 1026 aa  165  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.28 
 
 		 1292 aa  164  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.25 
 
 		 1130 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 		 756 aa  157  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 		 732 aa  155  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.69 
 
 		 693 aa  155  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  32.49 
 
 		 719 aa  154  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  35.44 
 
 		 676 aa  152  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  32.59 
 
 		 831 aa  153  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 		 770 aa  152  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 		 807 aa  149  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  35.22 
 
 		 2350 aa  149  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  34.14 
 
 		 346 aa  149  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  35.95 
 
 		 1916 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.61 
 
 		 930 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  33.53 
 
 		 387 aa  136  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  34.17 
 
 		 1085 aa  135  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  31.92 
 
 		 652 aa  135  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.38 
 
 		 668 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  36.07 
 
 		 1079 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  31.98 
 
 		 448 aa  128  9e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  33.43 
 
 		 579 aa  128  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  30.99 
 
 		 522 aa  127  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  32.28 
 
 		 772 aa  125  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  31.05 
 
 		 760 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  30.69 
 
 		 760 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  32.04 
 
 		 531 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  31.2 
 
 		 766 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.88 
 
 		 627 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  30.83 
 
 		 755 aa  119  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  34.27 
 
 		 284 aa  119  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.48 
 
 		 752 aa  119  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  28.11 
 
 		 391 aa  119  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.54 
 
 		 390 aa  118  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  30.57 
 
 		 588 aa  116  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  33.73 
 
 		 460 aa  115  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  28.49 
 
 		 709 aa  115  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  30.36 
 
 		 765 aa  115  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  29.74 
 
 		 772 aa  115  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  30.2 
 
 		 779 aa  115  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  30.36 
 
 		 766 aa  115  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  29.35 
 
 		 841 aa  115  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  30.36 
 
 		 542 aa  114  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  30.79 
 
 		 504 aa  113  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  31.19 
 
 		 359 aa  111  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  25.52 
 
 		 1112 aa  110  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  25.52 
 
 		 1070 aa  110  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  25.52 
 
 		 1070 aa  110  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.7 
 
 		 930 aa  108  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.09 
 
 		 343 aa  108  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  28.62 
 
 		 643 aa  107  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  30.45 
 
 		 789 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  30.45 
 
 		 789 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  30.6 
 
 		 1266 aa  107  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  33.54 
 
 		 498 aa  106  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  26.87 
 
 		 995 aa  105  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  29.38 
 
 		 362 aa  104  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  28.09 
 
 		 1088 aa  103  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  36.45 
 
 		 1163 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.1 
 
 		 1146 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  32.17 
 
 		 347 aa  103  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.39 
 
 		 341 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  29.43 
 
 		 491 aa  102  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  26.84 
 
 		 1012 aa  102  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.86 
 
 		 863 aa  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  27.54 
 
 		 786 aa  101  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  32.21 
 
 		 805 aa  100  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  31.87 
 
 		 487 aa  99.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  26.47 
 
 		 954 aa  98.6  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  28.75 
 
 		 858 aa  97.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  38.29 
 
 		 694 aa  97.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.13 
 
 		 1015 aa  97.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2644  hypothetical protein  29.45 
 
 		 359 aa  96.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0696665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  25.93 
 
 		 994 aa  96.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.06 
 
 		 664 aa  96.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.6 
 
 		 493 aa  95.5  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.84 
 
 		 1107 aa  95.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 307 aa  93.2  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  27.71 
 
 		 355 aa  92  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  31.19 
 
 		 404 aa  91.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  25 
 
 		 993 aa  90.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>