More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1493 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  42.34 
 
 
937 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  42.46 
 
 
937 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 
1107 aa  2226    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  44.28 
 
 
867 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  41.89 
 
 
1041 aa  612  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  39.62 
 
 
863 aa  536  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  38.2 
 
 
892 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.35 
 
 
1015 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  36.72 
 
 
886 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  34.99 
 
 
925 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  31.41 
 
 
761 aa  340  7e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  39.69 
 
 
482 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  31.94 
 
 
811 aa  265  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  35.8 
 
 
748 aa  258  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  37.88 
 
 
508 aa  255  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  38.32 
 
 
416 aa  252  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  35.06 
 
 
1263 aa  228  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  39.88 
 
 
354 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  26.84 
 
 
1085 aa  213  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  33.33 
 
 
1266 aa  212  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  32.41 
 
 
757 aa  206  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.56 
 
 
713 aa  192  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.64 
 
 
1749 aa  155  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.77 
 
 
1344 aa  147  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  42.65 
 
 
448 aa  140  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  28.94 
 
 
1024 aa  140  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  34.97 
 
 
2491 aa  139  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  36.36 
 
 
307 aa  129  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.81 
 
 
472 aa  127  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.69 
 
 
476 aa  124  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  33.97 
 
 
296 aa  124  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  30.87 
 
 
242 aa  124  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  41.97 
 
 
347 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  36.11 
 
 
467 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  28.35 
 
 
2132 aa  119  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  26.06 
 
 
559 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  26.23 
 
 
558 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0507  hypothetical protein  24.95 
 
 
614 aa  116  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37047  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  30.57 
 
 
601 aa  108  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  38.46 
 
 
384 aa  107  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  37.92 
 
 
772 aa  106  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  31.71 
 
 
526 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  31.88 
 
 
1744 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  36.57 
 
 
204 aa  102  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  33.61 
 
 
247 aa  101  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  38.6 
 
 
286 aa  101  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 
528 aa  99.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  29.77 
 
 
998 aa  99  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  37.67 
 
 
291 aa  99  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  30.45 
 
 
569 aa  98.6  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  35.35 
 
 
375 aa  98.6  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  27.65 
 
 
648 aa  98.2  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  34.4 
 
 
355 aa  97.8  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  34 
 
 
766 aa  97.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  33.09 
 
 
304 aa  95.9  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  32.84 
 
 
1351 aa  95.9  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
436 aa  95.5  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  30.15 
 
 
685 aa  95.5  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  34.08 
 
 
490 aa  94.7  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  30 
 
 
421 aa  94  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  27.3 
 
 
802 aa  94.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  26.2 
 
 
1088 aa  91.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  33.2 
 
 
760 aa  91.3  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  32.8 
 
 
779 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  32.8 
 
 
542 aa  89.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  32.53 
 
 
760 aa  90.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  33.67 
 
 
396 aa  90.1  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  32.8 
 
 
765 aa  89.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 
412 aa  89.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 
447 aa  89  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  24.52 
 
 
558 aa  88.6  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  32.11 
 
 
451 aa  88.2  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  33.33 
 
 
446 aa  88.2  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  29.67 
 
 
788 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 
451 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  29.67 
 
 
788 aa  87  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  32.4 
 
 
755 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
437 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  34.76 
 
 
413 aa  87  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  32.22 
 
 
1017 aa  86.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  33.18 
 
 
565 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  30.56 
 
 
716 aa  86.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  32.4 
 
 
772 aa  86.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  32 
 
 
766 aa  85.9  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  30.17 
 
 
528 aa  85.9  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  30.23 
 
 
788 aa  85.9  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  33.17 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  32.8 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  33.16 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  29.69 
 
 
631 aa  84.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  31.79 
 
 
620 aa  84.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  33.16 
 
 
451 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
440 aa  84.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 
445 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 
459 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  31.84 
 
 
414 aa  84  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
445 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  32.02 
 
 
434 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>