144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0837 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1085 aa  2211    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.59 
 
 		 1107 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  26.08 
 
 		 1041 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  27.06 
 
 		 867 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  24.1 
 
 		 1015 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  23.65 
 
 		 863 aa  187  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  26.36 
 
 		 886 aa  179  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  26.15 
 
 		 892 aa  178  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  24.87 
 
 		 937 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  25 
 
 		 937 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  32.29 
 
 		 766 aa  160  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  32.29 
 
 		 760 aa  160  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  31.94 
 
 		 760 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  31.25 
 
 		 766 aa  158  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  37.45 
 
 		 341 aa  158  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  23.77 
 
 		 925 aa  158  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  31.25 
 
 		 772 aa  158  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  31.25 
 
 		 779 aa  157  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  31.25 
 
 		 765 aa  156  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  30.56 
 
 		 755 aa  156  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  30.17 
 
 		 531 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  30.18 
 
 		 542 aa  150  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  27.3 
 
 		 1266 aa  142  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  35.18 
 
 		 421 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  34.17 
 
 		 1351 aa  135  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  36.44 
 
 		 399 aa  135  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  34.65 
 
 		 400 aa  134  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  37.55 
 
 		 400 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  35.65 
 
 		 467 aa  128  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.19 
 
 		 348 aa  128  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.19 
 
 		 348 aa  128  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  24.15 
 
 		 1012 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  22.92 
 
 		 748 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  35.84 
 
 		 399 aa  121  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  23.86 
 
 		 954 aa  121  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  30.81 
 
 		 1088 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1052 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  28.21 
 
 		 994 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  36.08 
 
 		 643 aa  119  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  29.06 
 
 		 993 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  29.58 
 
 		 347 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  27.8 
 
 		 772 aa  115  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  28.44 
 
 		 1070 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  28.44 
 
 		 1112 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  28.44 
 
 		 1070 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  37.84 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  29 
 
 		 995 aa  112  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  32.52 
 
 		 498 aa  112  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  36.67 
 
 		 789 aa  112  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  36.67 
 
 		 789 aa  112  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  33.48 
 
 		 858 aa  111  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  36.32 
 
 		 399 aa  110  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  27.78 
 
 		 1011 aa  107  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  34.12 
 
 		 344 aa  106  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  22.99 
 
 		 811 aa  105  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  25.28 
 
 		 877 aa  104  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  37.67 
 
 		 400 aa  102  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  25.44 
 
 		 761 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  42.86 
 
 		 312 aa  96.3  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  26.41 
 
 		 718 aa  92  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  35.33 
 
 		 474 aa  91.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.35 
 
 		 1263 aa  86.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  27.42 
 
 		 1024 aa  84  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1231 aa  80.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  34.59 
 
 		 951 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  37.1 
 
 		 587 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  23.89 
 
 		 998 aa  75.1  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  26.54 
 
 		 692 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1587  TIR protein  36.43 
 
 		 275 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0118312 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  26.34 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  25.76 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  33.64 
 
 		 197 aa  70.1  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.17 
 
 		 1086 aa  70.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  33.22 
 
 		 571 aa  68.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  23.93 
 
 		 1749 aa  67.8  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  29.61 
 
 		 559 aa  67.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.24 
 
 		 1091 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  29.03 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  25.2 
 
 		 539 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  34.81 
 
 		 291 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  25.33 
 
 		 809 aa  62.4  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  29.32 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  62  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  26.05 
 
 		 1335 aa  61.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  23.87 
 
 		 1344 aa  60.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  25 
 
 		 765 aa  58.5  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  31.19 
 
 		 1106 aa  58.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  25 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  26.02 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1105  hypothetical protein  34.04 
 
 		 314 aa  57.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000125481  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  25.32 
 
 		 384 aa  57.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  31.06 
 
 		 205 aa  57.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  27 
 
 		 374 aa  56.6  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.05 
 
 		 1655 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  34 
 
 		 637 aa  56.2  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  29.22 
 
 		 486 aa  55.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  31.78 
 
 		 238 aa  55.1  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  23.99 
 
 		 713 aa  55.1  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  24.55 
 
 		 2132 aa  54.3  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  31.12 
 
 		 273 aa  54.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>