33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1428 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  64.58 
 
 		 1015 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  83.06 
 
 		 1041 aa  811    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  100 
 
 		 748 aa  1529    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  41.85 
 
 		 925 aa  340  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.46 
 
 		 892 aa  280  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  35.94 
 
 		 886 aa  275  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.8 
 
 		 1107 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.84 
 
 		 937 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34.84 
 
 		 937 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  34.46 
 
 		 863 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.41 
 
 		 867 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  27.5 
 
 		 811 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  20.7 
 
 		 761 aa  128  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  22.92 
 
 		 1085 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  40.94 
 
 		 527 aa  97.8  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  31.11 
 
 		 538 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 1083 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0507  hypothetical protein  22.22 
 
 		 614 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37047  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  29.52 
 
 		 2198 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  35.29 
 
 		 998 aa  55.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21147  predicted protein  26.05 
 
 		 307 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  24.35 
 
 		 307 aa  47.4  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  23.62 
 
 		 215 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 240 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  24 
 
 		 213 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  23.83 
 
 		 207 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  23.2 
 
 		 214 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  31.58 
 
 		 1266 aa  45.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  23.49 
 
 		 210 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  28.46 
 
 		 185 aa  44.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  26.09 
 
 		 200 aa  44.3  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.26784 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08796  small monomeric GTPase (Gtr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09650)  24.56 
 
 		 332 aa  44.3  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  27.05 
 
 		 254 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>