150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2056 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1107    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  37.95 
 
 
558 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  36.64 
 
 
558 aa  290  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.94 
 
 
508 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.43 
 
 
1263 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.72 
 
 
1107 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  28.6 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  29.67 
 
 
509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  30.74 
 
 
416 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.83 
 
 
1041 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  25.35 
 
 
528 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.74 
 
 
354 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  28.94 
 
 
1024 aa  98.6  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.06 
 
 
867 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  27.14 
 
 
863 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  24.45 
 
 
1749 aa  92.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  24.48 
 
 
757 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  30.47 
 
 
1088 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  32.84 
 
 
892 aa  87.8  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  22.01 
 
 
713 aa  87.8  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  24.15 
 
 
1344 aa  82.8  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.91 
 
 
1015 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.52 
 
 
886 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  29.17 
 
 
937 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  29.17 
 
 
937 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  25.44 
 
 
531 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  28.15 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  25.83 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  28.57 
 
 
484 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  32.38 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.52 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  28.57 
 
 
569 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  29.83 
 
 
528 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  22.68 
 
 
972 aa  67.4  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  29.61 
 
 
1085 aa  67  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  27.31 
 
 
296 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  31.63 
 
 
1611 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  27.36 
 
 
802 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
414 aa  64.7  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  27.78 
 
 
467 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.89 
 
 
472 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.23 
 
 
242 aa  60.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  27.43 
 
 
440 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  28.51 
 
 
307 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 
459 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  28.93 
 
 
648 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  29.38 
 
 
490 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
475 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  28.41 
 
 
434 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  33.33 
 
 
499 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  26.52 
 
 
2132 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  34.98 
 
 
761 aa  57.4  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  33.33 
 
 
1744 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 
437 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 
437 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  25.6 
 
 
149 aa  57  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 
471 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  27.16 
 
 
601 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 
436 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  26.54 
 
 
1266 aa  56.2  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
445 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 
421 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 
447 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
450 aa  56.2  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.1 
 
 
305 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  21.6 
 
 
925 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  27.38 
 
 
446 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
451 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 
412 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
460 aa  55.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
445 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
437 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
441 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
469 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  25.7 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
432 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  27.81 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  25.82 
 
 
396 aa  52.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
473 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 
444 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  27.76 
 
 
439 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  27.25 
 
 
631 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  26.24 
 
 
580 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  27.32 
 
 
414 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29610  predicted protein  25.93 
 
 
630 aa  51.6  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.926539  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  31.01 
 
 
451 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  28.19 
 
 
421 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 
439 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  29.1 
 
 
2580 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  29.17 
 
 
413 aa  50.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  28.99 
 
 
980 aa  50.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  30.2 
 
 
1496 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4538  leucine-rich repeat protein  40 
 
 
225 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.22 
 
 
653 aa  50.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  30.23 
 
 
451 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  25.35 
 
 
791 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  27.84 
 
 
436 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
444 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>