163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1195 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  100 
 
 
204 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  37.78 
 
 
863 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.57 
 
 
1107 aa  101  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.43 
 
 
1041 aa  95.9  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  36.07 
 
 
892 aa  95.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  37.08 
 
 
307 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  34.67 
 
 
886 aa  92.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.94 
 
 
508 aa  91.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  35.78 
 
 
937 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  35.78 
 
 
937 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  30.68 
 
 
867 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.5 
 
 
1344 aa  86.3  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  30.06 
 
 
482 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  32.97 
 
 
448 aa  85.5  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  27.5 
 
 
242 aa  84.7  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  32.1 
 
 
1015 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  33.73 
 
 
802 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  24.02 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  26.7 
 
 
1263 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  35.23 
 
 
713 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.74 
 
 
467 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  28.41 
 
 
416 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.87 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  22.58 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.51 
 
 
472 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  26.59 
 
 
293 aa  71.6  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  29.8 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  25.83 
 
 
559 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  21.51 
 
 
434 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
412 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.85 
 
 
1749 aa  68.6  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  39.38 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  33.58 
 
 
757 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  23.5 
 
 
528 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  24.5 
 
 
490 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  28.36 
 
 
1088 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  21.31 
 
 
460 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  25.56 
 
 
414 aa  65.5  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  29.88 
 
 
2132 aa  65.1  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  28.17 
 
 
1481 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  25.56 
 
 
1481 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  27.91 
 
 
414 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.7 
 
 
1744 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  28.48 
 
 
396 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  25.35 
 
 
296 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  29.65 
 
 
761 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  32.62 
 
 
443 aa  62.8  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  30.32 
 
 
569 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 
439 aa  62  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  23.03 
 
 
478 aa  61.6  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  19.02 
 
 
437 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
421 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  19.02 
 
 
437 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  19.02 
 
 
437 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  33.54 
 
 
925 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  21.67 
 
 
445 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  31.03 
 
 
980 aa  59.3  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  24.06 
 
 
436 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  20.56 
 
 
471 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
447 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  27.89 
 
 
2198 aa  58.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  20 
 
 
444 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  23.37 
 
 
447 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  19.46 
 
 
451 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  19.67 
 
 
432 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  27.61 
 
 
528 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  29.73 
 
 
291 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  29.44 
 
 
2324 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  25.17 
 
 
432 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  39.76 
 
 
675 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  22.08 
 
 
436 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  25.79 
 
 
447 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  21.23 
 
 
440 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  19.44 
 
 
441 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  19.57 
 
 
469 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  25.16 
 
 
453 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  30.38 
 
 
484 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  24.53 
 
 
446 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  21.74 
 
 
580 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  27.81 
 
 
972 aa  56.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  24.82 
 
 
1611 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  28.22 
 
 
2491 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  22.15 
 
 
451 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  21.48 
 
 
451 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
475 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  34.95 
 
 
1112 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  19.46 
 
 
451 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  34.41 
 
 
1070 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  34.41 
 
 
1070 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  19.13 
 
 
439 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  39.8 
 
 
225 aa  54.7  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.15 
 
 
1024 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  29.34 
 
 
263 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  19.79 
 
 
437 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  24.83 
 
 
558 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  24.1 
 
 
1459 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  29.41 
 
 
1508 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  19.44 
 
 
437 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.78 
 
 
1351 aa  52.4  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  23.68 
 
 
499 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>