249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0149 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 436 aa  894    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  72.55 
 
 		 414 aa  624  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  67.91 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  64.58 
 
 		 421 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  63.07 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  62.07 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  53.83 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  53.3 
 
 		 447 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  52.52 
 
 		 447 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  52.76 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  53.22 
 
 		 453 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  52.1 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  51.36 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  50.87 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  50.72 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  50.86 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  51.11 
 
 		 451 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  49.65 
 
 		 475 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  49.63 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  46.15 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  45.79 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  44.5 
 
 		 490 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  45.93 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  44.31 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  44.31 
 
 		 446 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  46.06 
 
 		 445 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  44.94 
 
 		 441 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  45.15 
 
 		 438 aa  352  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  46.4 
 
 		 499 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  46.02 
 
 		 440 aa  348  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 		 464 aa  342  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  43.65 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 		 445 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  43.63 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  43.38 
 
 		 444 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  47.35 
 
 		 450 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  40.9 
 
 		 439 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  40.82 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  41.29 
 
 		 444 aa  326  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  41.77 
 
 		 473 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  40.64 
 
 		 437 aa  299  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  34.2 
 
 		 484 aa  228  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  35.16 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  40 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  36.81 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35 
 
 		 1041 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.83 
 
 		 892 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.46 
 
 		 1015 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.9 
 
 		 867 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  35.16 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.73 
 
 		 937 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.69 
 
 		 863 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.79 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.75 
 
 		 1107 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.8 
 
 		 1263 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  29.15 
 
 		 937 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  29.27 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 713 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  34.92 
 
 		 761 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  33.7 
 
 		 757 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  32.18 
 
 		 886 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  26.97 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.4 
 
 		 1749 aa  64.3  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.93 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  22.81 
 
 		 925 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  27.23 
 
 		 972 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  34.59 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  33.54 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  32.79 
 
 		 791 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  29.23 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.11 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.72 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62257  predicted protein  42.86 
 
 		 854 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.374999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  29.69 
 
 		 1395 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  31.21 
 
 		 2324 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1498 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.21 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  22.08 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  35.04 
 
 		 1395 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  28.23 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  34.12 
 
 		 615 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2783  serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0477185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  28.39 
 
 		 528 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  36 
 
 		 558 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  29.46 
 
 		 293 aa  54.7  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  30.6 
 
 		 291 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20262  predicted protein  25.95 
 
 		 290 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51279  predicted protein  29.11 
 
 		 298 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  29.75 
 
 		 980 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  26.6 
 
 		 580 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  24.56 
 
 		 293 aa  53.5  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1494 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 		 450 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1099  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000152305  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  34.12 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>