233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3027 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  83.64 
 
 		 446 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  100 
 
 		 434 aa  870    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  64.73 
 
 		 437 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  62.09 
 
 		 499 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  59.95 
 
 		 440 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  61.4 
 
 		 440 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  58.93 
 
 		 445 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  58.7 
 
 		 445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  57.18 
 
 		 460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  60 
 
 		 436 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  56.42 
 
 		 441 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  57.77 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  57.41 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  57.41 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  57.41 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  57.18 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  58.1 
 
 		 438 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  55.43 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  55.63 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  54.78 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  54.37 
 
 		 439 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  54.78 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  57.61 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  47.42 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  49.66 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  47.11 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  47.74 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  47.96 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  47.97 
 
 		 451 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  48.86 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  47.2 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  48.64 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  47.77 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  53.68 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  47.61 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  49.88 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  46.26 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  45.79 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  45.39 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 		 412 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  44.76 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  42.53 
 
 		 459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  46.23 
 
 		 414 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  45.94 
 
 		 421 aa  348  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  43 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  42.74 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  38.2 
 
 		 484 aa  246  6e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 1041 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  35.29 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  36.52 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.9 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  35.71 
 
 		 1263 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  32.52 
 
 		 892 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  37.08 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31.17 
 
 		 1015 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.16 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.58 
 
 		 867 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.02 
 
 		 1107 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  34.17 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.57 
 
 		 937 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34.57 
 
 		 937 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  36.71 
 
 		 761 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  26.4 
 
 		 863 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.8 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  35 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.73 
 
 		 713 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.09 
 
 		 886 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.41 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  32.39 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  21.51 
 
 		 204 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.26 
 
 		 1024 aa  67  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.88 
 
 		 1749 aa  66.6  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  35.46 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  26.35 
 
 		 925 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  25.82 
 
 		 757 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.92 
 
 		 1344 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  35.62 
 
 		 1395 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  33.33 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  28.41 
 
 		 559 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  30.89 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.8 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  35.62 
 
 		 1395 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  32.77 
 
 		 791 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 528 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  29.05 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  36.94 
 
 		 648 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  26.76 
 
 		 980 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  27.68 
 
 		 802 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  35.62 
 
 		 1393 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  25.9 
 
 		 384 aa  54.3  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32072  predicted protein  34.43 
 
 		 381 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186816  normal  0.540489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  29.66 
 
 		 2324 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  32.75 
 
 		 1494 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  32 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  28.72 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1498 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  27.88 
 
 		 2132 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  33.89 
 
 		 558 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  31.9 
 
 		 1088 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>