243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4016 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  80.58 
 
 		 451 aa  735    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  915    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  80.8 
 
 		 451 aa  736    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  79.69 
 
 		 451 aa  728    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  80.98 
 
 		 447 aa  744    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  80.76 
 
 		 447 aa  747    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  80.5 
 
 		 453 aa  735    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  76.24 
 
 		 446 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  79.69 
 
 		 451 aa  728    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  57.45 
 
 		 475 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  58.69 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  55.91 
 
 		 459 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  52.78 
 
 		 490 aa  455  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  55.05 
 
 		 413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  54.18 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  54.11 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  53.3 
 
 		 436 aa  438  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  53.38 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  53.96 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  51.47 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  54.41 
 
 		 421 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  51.6 
 
 		 436 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  49.1 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  50.57 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  49.21 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  50.23 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  50.23 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  50.45 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  51.46 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  49.33 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  50.34 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  49.66 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  49.21 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  48.08 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  46.44 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  47.84 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  45.16 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  44.61 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  48.03 
 
 		 450 aa  353  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  45.15 
 
 		 444 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  44.27 
 
 		 432 aa  342  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  44.47 
 
 		 444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  45.48 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  44.24 
 
 		 473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  42.92 
 
 		 439 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  37.5 
 
 		 484 aa  263  3e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  35.62 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  39.78 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34.74 
 
 		 1041 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  37.36 
 
 		 482 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.34 
 
 		 863 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  36.61 
 
 		 867 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  36.36 
 
 		 1015 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.01 
 
 		 508 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.48 
 
 		 1263 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  34.76 
 
 		 307 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  35.2 
 
 		 892 aa  87  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.13 
 
 		 937 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.5 
 
 		 1107 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.13 
 
 		 937 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  30.55 
 
 		 761 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  30.9 
 
 		 757 aa  80.5  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  32.29 
 
 		 886 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.51 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  29.41 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  33.11 
 
 		 713 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  27.62 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  25.44 
 
 		 1749 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  32.41 
 
 		 467 aa  67  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.75 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.89 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  30.12 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01750  Cdc2 cyclin-dependent kinase, putative  23.92 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.588501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  27.13 
 
 		 569 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  35.04 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20262  predicted protein  27.44 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  30 
 
 		 755 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  28.69 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  32.8 
 
 		 648 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.9 
 
 		 503 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  30.56 
 
 		 791 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1744 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  36 
 
 		 675 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.05 
 
 		 1024 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.73 
 
 		 1344 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  32.37 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  27.66 
 
 		 980 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  34.29 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  25.79 
 
 		 204 aa  57  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90135  cell division control protein  25.29 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0872901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1498 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13763  predicted protein  22.94 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.663512  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  32.21 
 
 		 149 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10647  predicted protein  43.86 
 
 		 75 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642206  normal  0.0385264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  33.58 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  30.85 
 
 		 601 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 		 612 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  24.41 
 
 		 925 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>