77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1475 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  34.68 
 
 		 757 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.38 
 
 		 1107 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  33.91 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.52 
 
 		 892 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.68 
 
 		 1041 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.57 
 
 		 713 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32.02 
 
 		 1263 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  28.4 
 
 		 416 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  38.83 
 
 		 863 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  36.04 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.24 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  28.57 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  34.51 
 
 		 1749 aa  59.3  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4538  leucine-rich repeat protein  41.89 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  35.65 
 
 		 886 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.88 
 
 		 476 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  32.5 
 
 		 569 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  32.68 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  30.77 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  33.04 
 
 		 2324 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  35.34 
 
 		 1024 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  39.8 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  25.38 
 
 		 478 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  32.82 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  37.62 
 
 		 528 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0946  hypothetical protein  32.41 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000225711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  37.04 
 
 		 937 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  37.21 
 
 		 543 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 436 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  32.18 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  37.04 
 
 		 937 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  28.31 
 
 		 648 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.07 
 
 		 1344 aa  51.6  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  31.58 
 
 		 1017 aa  51.6  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  29.7 
 
 		 867 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 		 439 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  28 
 
 		 434 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.95 
 
 		 1015 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  31.53 
 
 		 802 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  37.04 
 
 		 2132 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1269  leucine-rich repeat-containing protein  33.73 
 
 		 360 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.407419  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  30.63 
 
 		 490 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  35.92 
 
 		 656 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  26 
 
 		 446 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  26.51 
 
 		 436 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  26.71 
 
 		 440 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  32.26 
 
 		 2580 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  26.11 
 
 		 432 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  25.58 
 
 		 484 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 		 473 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.95 
 
 		 305 aa  45.8  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  28.38 
 
 		 413 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 475 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 421 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  26.85 
 
 		 528 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2365  leucine-rich repeat-containing protein  26.67 
 
 		 569 aa  45.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.505593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  26.87 
 
 		 559 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  24.17 
 
 		 1088 aa  45.1  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 		 444 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  30.68 
 
 		 467 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 		 471 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 		 412 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  25.52 
 
 		 445 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 		 469 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  30.19 
 
 		 761 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 		 437 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 		 460 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.23 
 
 		 653 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  26.14 
 
 		 980 aa  42.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 		 459 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  24.81 
 
 		 446 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  24.26 
 
 		 437 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  27.66 
 
 		 414 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  26.09 
 
 		 580 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.22 
 
 		 472 aa  42  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>