64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01620 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  100 
 
 		 656 aa  1331    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  34.12 
 
 		 648 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  33.88 
 
 		 1041 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  32.89 
 
 		 757 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  35 
 
 		 1024 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  34.65 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.71 
 
 		 1263 aa  77  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  31.6 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.63 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.28 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  27.63 
 
 		 863 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.38 
 
 		 1107 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.25 
 
 		 886 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  25.94 
 
 		 713 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  29.82 
 
 		 802 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.33 
 
 		 867 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  26.64 
 
 		 1749 aa  69.3  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.82 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  29.08 
 
 		 1088 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  28.27 
 
 		 937 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.11 
 
 		 892 aa  61.6  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  29.29 
 
 		 1015 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  28.27 
 
 		 937 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  29.38 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 653 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  24.41 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  30.54 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  26.58 
 
 		 528 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  34.57 
 
 		 443 aa  54.7  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.22 
 
 		 476 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  32.48 
 
 		 675 aa  54.3  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  27.18 
 
 		 925 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.65 
 
 		 305 aa  52.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  25.97 
 
 		 413 aa  51.2  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  27.23 
 
 		 242 aa  51.2  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  28.27 
 
 		 438 aa  51.2  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  25.97 
 
 		 204 aa  50.4  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  29.55 
 
 		 291 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  28.93 
 
 		 448 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  29.05 
 
 		 526 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  27.22 
 
 		 558 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  23.77 
 
 		 2491 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  35.92 
 
 		 225 aa  48.1  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  27.17 
 
 		 640 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  25.23 
 
 		 580 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  32.95 
 
 		 2132 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.68 
 
 		 1344 aa  48.1  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  30 
 
 		 972 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2892  hypothetical protein  25.42 
 
 		 354 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.798685  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2365  leucine-rich repeat-containing protein  30.83 
 
 		 569 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.505593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  35.9 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10572  Leucine Rich Repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02450)  31.25 
 
 		 543 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44362  predicted protein  36.78 
 
 		 1083 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  31.46 
 
 		 980 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  28.76 
 
 		 447 aa  44.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  26.21 
 
 		 467 aa  44.7  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  27.17 
 
 		 247 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  28.12 
 
 		 446 aa  44.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4538  leucine-rich repeat protein  27.49 
 
 		 225 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  26.32 
 
 		 1017 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  29.82 
 
 		 2324 aa  44.3  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 		 447 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 		 453 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 		 444 aa  43.9  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>