22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44362 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44362  predicted protein  100 
 
 
1083 aa  2246    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  36.75 
 
 
307 aa  56.6  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  37.4 
 
 
1041 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  32.86 
 
 
757 aa  53.5  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  34.07 
 
 
296 aa  52.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  37.36 
 
 
291 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  38.39 
 
 
863 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  35.71 
 
 
1263 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.71 
 
 
1015 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  34.58 
 
 
468 aa  50.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  38.17 
 
 
448 aa  49.7  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  38.67 
 
 
972 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32072  predicted protein  40.54 
 
 
381 aa  48.5  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186816  normal  0.540489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.45 
 
 
892 aa  48.1  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.61 
 
 
508 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.94 
 
 
1107 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  29.84 
 
 
1640 aa  46.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  37.21 
 
 
416 aa  45.8  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  39.74 
 
 
354 aa  45.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  33.62 
 
 
713 aa  45.1  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  36.78 
 
 
656 aa  45.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
436 aa  44.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>