186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2359 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 
296 aa  590  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  41.21 
 
 
482 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  39.09 
 
 
1041 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  34.98 
 
 
1263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  37.28 
 
 
757 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  35.39 
 
 
508 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.97 
 
 
1107 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  37.98 
 
 
892 aa  122  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  36.73 
 
 
416 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  33.78 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  29.51 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  41.01 
 
 
713 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  40.43 
 
 
863 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.03 
 
 
1015 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  41.01 
 
 
886 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
937 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
937 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  36.41 
 
 
867 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.02 
 
 
476 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  35.92 
 
 
761 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  38.46 
 
 
242 aa  93.6  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  35.59 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  35.68 
 
 
1024 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.17 
 
 
472 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  31.14 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  32.4 
 
 
448 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 
440 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  31.77 
 
 
1749 aa  80.9  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 
450 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  33.91 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  27.6 
 
 
1744 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  35 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  35.85 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  37.86 
 
 
475 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  29.1 
 
 
802 aa  75.5  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  29.65 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0946  hypothetical protein  36.79 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000225711 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  34.44 
 
 
149 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  36.59 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
447 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 
460 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
437 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 
441 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  26.88 
 
 
446 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 
437 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  27.62 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  27.22 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  28 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  27.61 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  30.17 
 
 
972 aa  68.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  27.32 
 
 
484 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  28.69 
 
 
1017 aa  69.3  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.92 
 
 
1344 aa  68.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  28.57 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  28.82 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  29.02 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  29.82 
 
 
2198 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  34.55 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  28.81 
 
 
980 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  26.97 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  31.18 
 
 
499 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  32.81 
 
 
528 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  30.46 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 
473 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
444 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  27.31 
 
 
559 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.29 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  30.27 
 
 
2132 aa  65.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 
469 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  27.74 
 
 
569 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  26.97 
 
 
438 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
444 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
439 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  32.7 
 
 
2491 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  26.44 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  27.96 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  25.35 
 
 
204 aa  63.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  33.7 
 
 
601 aa  63.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  32.21 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  22.55 
 
 
528 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  26.21 
 
 
580 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  26.17 
 
 
526 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  25.56 
 
 
1088 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  24.85 
 
 
925 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 
437 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>