134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03420 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  100 
 
 		 478 aa  959    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4254  HpaG LRR protein  41.63 
 
 		 275 aa  154  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.464149  normal  0.725082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  38.14 
 
 		 1041 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  33.02 
 
 		 757 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  32.89 
 
 		 648 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  38.81 
 
 		 354 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  36.15 
 
 		 1263 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  30.84 
 
 		 863 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.5 
 
 		 892 aa  97.1  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  34.78 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  38.5 
 
 		 1015 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  33.17 
 
 		 296 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  31.6 
 
 		 656 aa  90.5  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  36.04 
 
 		 1024 aa  89.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  35 
 
 		 508 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  35.8 
 
 		 886 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  30.84 
 
 		 867 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  37.17 
 
 		 482 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  36.45 
 
 		 416 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  25.63 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.94 
 
 		 1107 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.87 
 
 		 937 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.87 
 
 		 937 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  24.91 
 
 		 1749 aa  71.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  31.25 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  28.71 
 
 		 802 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  32.35 
 
 		 247 aa  67  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  32.52 
 
 		 446 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.93 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  25.68 
 
 		 543 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.48 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  30.39 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  30.65 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.61 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.15 
 
 		 653 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  31.66 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  33.51 
 
 		 761 aa  61.6  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  23.03 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  35.77 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  25.79 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  36.23 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  24.88 
 
 		 2491 aa  60.1  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1395 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0946  hypothetical protein  36.84 
 
 		 333 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000225711 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  27.16 
 
 		 2132 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.86 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  26.04 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1393 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  28.19 
 
 		 601 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 		 447 aa  57  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  29.37 
 
 		 2324 aa  56.6  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  27.57 
 
 		 283 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  28.14 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  30.07 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1744 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 437 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  29.8 
 
 		 499 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 437 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  25.38 
 
 		 225 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  28.35 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 		 447 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  27.52 
 
 		 447 aa  53.9  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 		 459 aa  53.5  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  24.81 
 
 		 528 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  31.49 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  23.76 
 
 		 925 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  24.17 
 
 		 1344 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  23.7 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  28.35 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  31.11 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  31.06 
 
 		 230 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  22.66 
 
 		 304 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  27.74 
 
 		 1017 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  25.13 
 
 		 716 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  30.14 
 
 		 640 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  50.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  27.27 
 
 		 1012 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  25.97 
 
 		 528 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  29.11 
 
 		 559 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  40.43 
 
 		 647 aa  50.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  31.12 
 
 		 438 aa  50.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 460 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 445 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  26.32 
 
 		 526 aa  50.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>