135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4631 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 
473 aa  934    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4632  hypothetical protein  32.03 
 
 
499 aa  126  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.48 
 
 
653 aa  80.9  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  37.97 
 
 
508 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
1041 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  39.57 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  35 
 
 
867 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  28.18 
 
 
528 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  39.37 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.59 
 
 
892 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.4 
 
 
1107 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 
473 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
439 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  39.71 
 
 
460 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  31.75 
 
 
980 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  33.86 
 
 
761 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  40.3 
 
 
1494 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  38.21 
 
 
447 aa  65.1  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  40.88 
 
 
471 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  33.58 
 
 
886 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 
444 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 
437 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
469 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  40.88 
 
 
441 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.93 
 
 
354 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.54 
 
 
1263 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  35.43 
 
 
1024 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  37.23 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  24 
 
 
863 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  38.06 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 
445 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 
453 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  35.37 
 
 
478 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 
437 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 
459 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.14 
 
 
937 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.33 
 
 
1015 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 
432 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  37.39 
 
 
648 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 
440 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  34.56 
 
 
413 aa  60.1  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
437 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  31.85 
 
 
451 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  32.89 
 
 
446 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.14 
 
 
937 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  34.36 
 
 
528 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  25.38 
 
 
757 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  34.38 
 
 
1744 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  35.04 
 
 
526 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.23 
 
 
1749 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 
464 aa  58.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  37.4 
 
 
447 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  33.11 
 
 
451 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.91 
 
 
305 aa  57  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  30.49 
 
 
490 aa  57  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 
412 aa  57  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  37.6 
 
 
1498 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  33.11 
 
 
440 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  32.45 
 
 
451 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  31.68 
 
 
2580 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 
445 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  37.96 
 
 
450 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  30.34 
 
 
656 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  40.58 
 
 
438 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  33.81 
 
 
580 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 
447 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  35.2 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  31.45 
 
 
296 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
451 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  30.56 
 
 
543 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  29.03 
 
 
713 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.71 
 
 
476 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  29.67 
 
 
1000 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  33.33 
 
 
499 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  26.92 
 
 
307 aa  53.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  34.4 
 
 
675 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 
414 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  26.81 
 
 
569 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  29.45 
 
 
436 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 
1281 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
441 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  31.29 
 
 
484 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  28.11 
 
 
640 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  32.11 
 
 
2324 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  33.11 
 
 
247 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
421 aa  50.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  30.57 
 
 
446 aa  50.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  44.44 
 
 
1496 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.08 
 
 
472 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  39.18 
 
 
1498 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  28.03 
 
 
283 aa  50.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  27.78 
 
 
293 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  32.58 
 
 
1088 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
475 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  30 
 
 
647 aa  50.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>