34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4632 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4632  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  966    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  34.47 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.1 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  41.03 
 
 		 863 aa  61.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  41.3 
 
 		 293 aa  54.3  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  40.7 
 
 		 508 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  37.27 
 
 		 675 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  50 
 
 		 1494 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  37.66 
 
 		 886 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  42.31 
 
 		 648 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  31.3 
 
 		 980 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  32.14 
 
 		 528 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  31.25 
 
 		 558 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  37.36 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.47 
 
 		 757 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  30.91 
 
 		 1088 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  32.26 
 
 		 396 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.24 
 
 		 1041 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.68 
 
 		 305 aa  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  39.08 
 
 		 1015 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  34.78 
 
 		 867 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  36.9 
 
 		 1263 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  37.65 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.34 
 
 		 307 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  34.83 
 
 		 247 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.4 
 
 		 1107 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  43 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.13 
 
 		 713 aa  43.9  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  38.55 
 
 		 482 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1744 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  42.68 
 
 		 444 aa  43.5  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  38.04 
 
 		 559 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  36.51 
 
 		 640 aa  43.5  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>