116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1508 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 
653 aa  1322    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  29.14 
 
 
757 aa  77.8  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.68 
 
 
713 aa  76.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  33.16 
 
 
1041 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.9 
 
 
1024 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  34.12 
 
 
482 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.13 
 
 
1263 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  24.15 
 
 
1088 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.74 
 
 
1107 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  30.34 
 
 
863 aa  64.3  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  34.53 
 
 
242 aa  63.9  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  29.48 
 
 
396 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  29.78 
 
 
416 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4632  hypothetical protein  22.87 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.71 
 
 
256 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  30.61 
 
 
648 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
439 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.22 
 
 
886 aa  60.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  29.37 
 
 
149 aa  60.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  29.61 
 
 
892 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  26.67 
 
 
580 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.24 
 
 
307 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  24.48 
 
 
473 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  31.03 
 
 
656 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  29.57 
 
 
1015 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  29.1 
 
 
867 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  28.24 
 
 
508 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.13 
 
 
305 aa  57.4  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  25.81 
 
 
1749 aa  57.4  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  32.54 
 
 
296 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  37.35 
 
 
252 aa  57  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.52 
 
 
248 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.23 
 
 
354 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.02 
 
 
248 aa  55.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.86 
 
 
251 aa  54.7  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  29.51 
 
 
528 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  28.81 
 
 
446 aa  54.3  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 
473 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 
436 aa  54.3  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.94 
 
 
253 aa  53.9  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  26.61 
 
 
271 aa  53.9  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 
267 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.28 
 
 
476 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 
267 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.4 
 
 
247 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 
437 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 
447 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  26.83 
 
 
761 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  30.49 
 
 
446 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
437 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
441 aa  52.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  30 
 
 
499 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.33 
 
 
317 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  29.41 
 
 
937 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  25.47 
 
 
640 aa  51.6  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  28.64 
 
 
478 aa  51.6  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
451 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  29.41 
 
 
937 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  28.24 
 
 
448 aa  51.2  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  28.81 
 
 
451 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  28.81 
 
 
451 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  30.63 
 
 
440 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  27.22 
 
 
559 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  26.39 
 
 
1262 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.73 
 
 
243 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
447 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  26.35 
 
 
413 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
432 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 
459 aa  48.9  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
471 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  27.68 
 
 
447 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
469 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
460 aa  48.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  27.68 
 
 
451 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 
444 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  42.59 
 
 
261 aa  47.8  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  27.91 
 
 
304 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.15 
 
 
247 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
1281 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  29.33 
 
 
434 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  42.59 
 
 
261 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
445 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 
421 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  25.41 
 
 
2132 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 
453 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  33.64 
 
 
293 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  28.48 
 
 
558 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  25.84 
 
 
475 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  22.68 
 
 
569 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  26.86 
 
 
490 aa  45.8  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  29.58 
 
 
328 aa  45.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  24.48 
 
 
2491 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.48 
 
 
251 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  26.78 
 
 
1275 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  27.61 
 
 
283 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  27.12 
 
 
685 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 
437 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 
437 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  38.1 
 
 
195 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>