274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4508 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 317 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.73 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.27 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  40.98 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  41 
 
 		 243 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.91 
 
 		 247 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.66 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.62 
 
 		 248 aa  178  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.31 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.09 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.92 
 
 		 248 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.6 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.31 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  36.8 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  36.4 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.88 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.33 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  34.42 
 
 		 328 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.65 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.18 
 
 		 250 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  35.59 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.15 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  26.28 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.5 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1818  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.57 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  34.72 
 
 		 261 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  34.54 
 
 		 261 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.97 
 
 		 380 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.5 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  31.66 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  31.66 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.66 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.16 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  27.92 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.7 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.4 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.4 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.72 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4356  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.05 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.871364  normal  0.139855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3396  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.54 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342322  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.7 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  30 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.23 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  27.47 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3445  helix-turn-helix domain-containing protein  24.75 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1097  hypothetical protein  30 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.149406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  29.61 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.08 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.2 
 
 		 500 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  31.38 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2745  fic family protein  28.5 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.413938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.6 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.57 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.53 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.05 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0755  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.28 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.973476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.39 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.13 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  26.48 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0207  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.72 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  33.98 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2534  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.24 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  28.44 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  26.91 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.91 
 
 		 387 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.79 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.77 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3106  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.87 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.45 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4940  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.35 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857933  normal  0.500548 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  27.27 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.23 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  27.27 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  29.45 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.49 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.13 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0913  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.2 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.876617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0838  Fic family protein  29.21 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0586885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3558  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.7 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.58 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.37 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.8 
 
 		 434 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0201  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.7 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496594 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.6 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2657  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.86 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3262  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.57 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.793632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10760  hypothetical protein  27.8 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.553511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.31 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0426  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.1 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.444251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.98 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.46 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  25.46 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.65 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  25.68 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  27.54 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>