177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0293 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3396  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 		 222 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342322  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3516  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.26 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.438285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.04 
 
 		 380 aa  86.3  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.42 
 
 		 380 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.35 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  29.35 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  29.35 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.52 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.52 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.61 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.84 
 
 		 386 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.17 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.08 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.72 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  35.16 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.69 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.82 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.98 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.93 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  26.83 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  32.17 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.38 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.37 
 
 		 358 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2548  hypothetical protein  26.71 
 
 		 348 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4245  mobile mystery protein B  29.11 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.91 
 
 		 502 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  31.33 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  30.17 
 
 		 356 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  28.36 
 
 		 359 aa  53.5  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.69 
 
 		 443 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  33.77 
 
 		 328 aa  52.8  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.78 
 
 		 371 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.87 
 
 		 434 aa  52  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  30.72 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.53 
 
 		 387 aa  52  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.47 
 
 		 313 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.01 
 
 		 333 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2116  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.96 
 
 		 426 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0426  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.68 
 
 		 417 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.444251  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.01 
 
 		 333 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  25.32 
 
 		 348 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  25.27 
 
 		 348 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 328 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.29 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1842  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 417 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  27.94 
 
 		 397 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.13 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.63 
 
 		 374 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.63 
 
 		 374 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.63 
 
 		 374 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4212  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.94 
 
 		 424 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3790  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.87 
 
 		 402 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0861  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.03 
 
 		 400 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  32.06 
 
 		 342 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.27 
 
 		 304 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0444  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.67 
 
 		 365 aa  48.9  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.401408 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  27.81 
 
 		 377 aa  48.5  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.29 
 
 		 376 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 371 aa  48.5  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.63 
 
 		 372 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.71 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 412 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  29.77 
 
 		 331 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.82 
 
 		 316 aa  48.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 370 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.78 
 
 		 381 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1908  hypothetical protein  35.79 
 
 		 395 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  26.76 
 
 		 346 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.39 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.98 
 
 		 384 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.28 
 
 		 387 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  26.9 
 
 		 314 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.65 
 
 		 393 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  31.73 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.48 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  29.41 
 
 		 431 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0445  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.74 
 
 		 401 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.78 
 
 		 387 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.71 
 
 		 408 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  31.65 
 
 		 364 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  29.41 
 
 		 431 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  30.36 
 
 		 371 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  25.78 
 
 		 358 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.09 
 
 		 400 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.69 
 
 		 392 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0731  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.97 
 
 		 446 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.69 
 
 		 392 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 393 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 367 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2238  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.47 
 
 		 485 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76756  decreased coverage  0.000875847 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  23.03 
 
 		 331 aa  45.8  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  32 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.77 
 
 		 394 aa  45.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4175  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.47 
 
 		 456 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4624  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.09 
 
 		 397 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0152  Fic family protein  27.5 
 
 		 416 aa  45.4  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0055  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.51 
 
 		 434 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0125874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>