165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0426 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0426  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 417 aa  857    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.444251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2840  filamentation induced by cAMP protein Fic  55.64 
 
 		 411 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4061  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.54 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0851  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.74 
 
 		 404 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0093  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.14 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0025  putative cAMP-induced filamentation protein  43.75 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.337972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2534  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.79 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2460  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.16 
 
 		 396 aa  302  8.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1372  fic family protein  38.19 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3790  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.51 
 
 		 402 aa  280  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3358  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.47 
 
 		 413 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0445  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.66 
 
 		 401 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0861  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.81 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0014  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.19 
 
 		 406 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1908  hypothetical protein  38.71 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4212  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.06 
 
 		 424 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0896  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.68 
 
 		 406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4423  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.23 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.395598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4624  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.92 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2298  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.45 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266378  normal  0.174945 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4020  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.79 
 
 		 400 aa  229  9e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142086  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4217  hypothetical protein  36.88 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921636  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1842  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.17 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36540  Fic (filamentation induced by cAMP) protein  32.05 
 
 		 374 aa  200  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4032  hypothetical protein  41.38 
 
 		 224 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2568  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.66 
 
 		 410 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0317  hypothetical protein  46.6 
 
 		 172 aa  96.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0608446  normal  0.0902028 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  27.06 
 
 		 252 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.68 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.99 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.13 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  29 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.1 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.05 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.33 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  23.33 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  23.33 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  25.84 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.3 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.43 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0061  fic family protein  27.57 
 
 		 348 aa  57  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  31.73 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  31.73 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.79 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.11 
 
 		 309 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  27.64 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.09 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.18 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.79 
 
 		 316 aa  55.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  29.59 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.46 
 
 		 380 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.65 
 
 		 267 aa  53.5  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.12 
 
 		 248 aa  53.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.11 
 
 		 267 aa  53.1  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.77 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.11 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  27.78 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.5 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.56 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.65 
 
 		 371 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.65 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  30.65 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3516  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.95 
 
 		 207 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.438285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.86 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.3 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  28.81 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.84 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.68 
 
 		 219 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.86 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.23 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  23.53 
 
 		 330 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.28 
 
 		 248 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.59 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.71 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3019  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.81 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.84 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.21 
 
 		 253 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.62 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.84 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.26 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.32 
 
 		 333 aa  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.84 
 
 		 371 aa  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.71 
 
 		 326 aa  49.7  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.32 
 
 		 333 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  24.02 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  35.71 
 
 		 331 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  40.28 
 
 		 195 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  31.48 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.36 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.67 
 
 		 511 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.82 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2034  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.9 
 
 		 348 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.14 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.84 
 
 		 365 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>