186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2568 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2568  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 410 aa  824    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1842  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.19 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0093  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.78 
 
 		 404 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0851  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2840  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.46 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4061  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.75 
 
 		 397 aa  217  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0025  putative cAMP-induced filamentation protein  35 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.337972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0014  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.85 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0426  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.66 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.444251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3790  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.58 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1908  hypothetical protein  31.94 
 
 		 395 aa  186  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0861  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.57 
 
 		 400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2534  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.76 
 
 		 397 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2460  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.68 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0896  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.24 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1372  fic family protein  33.7 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4212  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.32 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2298  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.85 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266378  normal  0.174945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0445  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.08 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4217  hypothetical protein  33.49 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921636  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4020  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.25 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142086  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4624  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.92 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3358  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.5 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4423  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.12 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.395598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36540  Fic (filamentation induced by cAMP) protein  32.03 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4032  hypothetical protein  34.8 
 
 		 224 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.93 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.87 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.4 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.98 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.34 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.02 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.14 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.37 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.2 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.64 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.6 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  25.33 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.33 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.34 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  25.33 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.59 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.69 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  24.23 
 
 		 373 aa  57  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.84 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.32 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  26.17 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.17 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.75 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3396  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.41 
 
 		 222 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342322  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.92 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.47 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.3 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.56 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  27.9 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.25 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  28.63 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.44 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.01 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  32.93 
 
 		 356 aa  53.5  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  23.43 
 
 		 360 aa  53.1  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  26.29 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.62 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.64 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  30.47 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.7 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  25.38 
 
 		 328 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.71 
 
 		 363 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  25.85 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.25 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.31 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.66 
 
 		 368 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  27.87 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 358 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.1 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  27.87 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3534  mobile mystery protein B  30.07 
 
 		 194 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.56 
 
 		 267 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.92 
 
 		 357 aa  50.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.56 
 
 		 267 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  28.95 
 
 		 376 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.24 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  27.01 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  30.47 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.98 
 
 		 360 aa  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  26.27 
 
 		 314 aa  50.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  36.67 
 
 		 373 aa  50.1  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.33 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.76 
 
 		 373 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.42 
 
 		 256 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  27.97 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  28.73 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.95 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  26.53 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  26.05 
 
 		 331 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  33.33 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.91 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.81 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2565  mobile mystery protein B  30.07 
 
 		 194 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>