More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2057 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 377 aa  783    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  64.1 
 
 		 377 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  55.44 
 
 		 377 aa  456  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  44.48 
 
 		 388 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.73 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.12 
 
 		 380 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.79 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.36 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.71 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.52 
 
 		 393 aa  272  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.31 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.06 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.53 
 
 		 387 aa  262  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  40.53 
 
 		 358 aa  262  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.83 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.87 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.3 
 
 		 387 aa  255  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.25 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  41.6 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  41.59 
 
 		 386 aa  249  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.19 
 
 		 389 aa  248  9e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  39.47 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.55 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.24 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.55 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.07 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  35.14 
 
 		 368 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.84 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.24 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.28 
 
 		 371 aa  209  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  35.21 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.88 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.94 
 
 		 438 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.42 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.66 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.69 
 
 		 395 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.16 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.98 
 
 		 392 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.78 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.61 
 
 		 391 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.76 
 
 		 401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  34.41 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.38 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  34.68 
 
 		 356 aa  155  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.2 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.08 
 
 		 360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.38 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.4 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  31.49 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.3 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 392 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.06 
 
 		 394 aa  142  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  31.49 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.44 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.55 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.62 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  30.1 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.66 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.56 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.37 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.17 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.45 
 
 		 412 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  30.63 
 
 		 359 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  33.04 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  33.04 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.2 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  30.86 
 
 		 371 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.54 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.65 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.43 
 
 		 359 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.02 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  30.62 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.84 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.97 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  30.66 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.76 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.41 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.43 
 
 		 422 aa  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.66 
 
 		 358 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  26.33 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  33.19 
 
 		 394 aa  109  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.99 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  28.12 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.99 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  26.7 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.38 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.44 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.67 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.01 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.65 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.79 
 
 		 358 aa  96.3  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0297  hypothetical protein  35.85 
 
 		 200 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.38 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.48 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4178  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.46 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.130851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.33 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.4 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  28.75 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.01 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>