265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2123 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  755    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  61.41 
 
 		 371 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.79 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.96 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.63 
 
 		 384 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.85 
 
 		 374 aa  319  5e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  38.76 
 
 		 373 aa  266  4e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.88 
 
 		 384 aa  248  9e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.32 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.51 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.14 
 
 		 377 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  35.04 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.71 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  33.15 
 
 		 377 aa  216  4e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.26 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.96 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.83 
 
 		 391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  35 
 
 		 388 aa  212  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.66 
 
 		 393 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  36.11 
 
 		 358 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.21 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.38 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.11 
 
 		 389 aa  205  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.69 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.96 
 
 		 392 aa  202  9e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.1 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  42.63 
 
 		 383 aa  196  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  36.2 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.66 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.24 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.72 
 
 		 438 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  34.27 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.4 
 
 		 390 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.32 
 
 		 401 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.77 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.58 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.29 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.19 
 
 		 381 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.09 
 
 		 380 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.6 
 
 		 381 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.94 
 
 		 401 aa  156  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.65 
 
 		 394 aa  155  8e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.17 
 
 		 363 aa  153  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  31.31 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  31.01 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.19 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.02 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.92 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.52 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.64 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  31 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  28.61 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.12 
 
 		 385 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.68 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.4 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.39 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.95 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  30.14 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.96 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.01 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  28.74 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.79 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.61 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.34 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  26.61 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.1 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  30.79 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.61 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.27 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  31.09 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  29.04 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  29.04 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.11 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.38 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.25 
 
 		 412 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.2 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0297  hypothetical protein  30.59 
 
 		 200 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.18 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.2 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.35 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.76 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.57 
 
 		 393 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.91 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.42 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.4 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4178  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.89 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.130851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.66 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.33 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.65 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  24.92 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.11 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  27.11 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  27.11 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.33 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.39 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.12 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  26.07 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.29 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.89 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>