267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4266 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  769    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  73.12 
 
 		 375 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  69.95 
 
 		 363 aa  539  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  62.53 
 
 		 371 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  62.18 
 
 		 358 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  61.03 
 
 		 342 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  55.25 
 
 		 359 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.83 
 
 		 356 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.68 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.34 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  43.4 
 
 		 373 aa  276  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.18 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0297  hypothetical protein  68.16 
 
 		 200 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.18 
 
 		 357 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.9 
 
 		 360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.06 
 
 		 361 aa  252  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.4 
 
 		 377 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.39 
 
 		 373 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  40.23 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  39.43 
 
 		 359 aa  236  3e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  39.29 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  30.03 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  31 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.49 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.34 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.84 
 
 		 384 aa  142  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.88 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.93 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.77 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.82 
 
 		 371 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  30.65 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.37 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.07 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.45 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.91 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.38 
 
 		 384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  29.45 
 
 		 386 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.4 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  29 
 
 		 387 aa  129  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.61 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.03 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.38 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.38 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  28.45 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  28.65 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.65 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.13 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.37 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  29.91 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  28.96 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.2 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.17 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.41 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.75 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  28.74 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.18 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.12 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.06 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.32 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  29 
 
 		 384 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.91 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.66 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.32 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.62 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.11 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.86 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.62 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.56 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.95 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2305  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.58 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.48 
 
 		 393 aa  75.9  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  29.54 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  30.85 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.7 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  30.85 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  37.6 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.98 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.83 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.7 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0152  Fic family protein  33.33 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.4 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.13 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.3 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.2 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.19 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.19 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  29.63 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  28.93 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.63 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  31.75 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  38.71 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  34.19 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1450  Fic family protein  29.37 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.19 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2116  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.32 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.24 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.38 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>