More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2669 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  100 
 
 		 330 aa  684    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  58.7 
 
 		 336 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  59.75 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  51.23 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  52.45 
 
 		 331 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  52.96 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  53.94 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.39 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.39 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  48.23 
 
 		 352 aa  279  4e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  52.57 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.72 
 
 		 316 aa  242  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  62.9 
 
 		 224 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  55.38 
 
 		 175 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  33.47 
 
 		 359 aa  99.8  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  53.19 
 
 		 467 aa  92.4  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.96 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 368 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.1 
 
 		 349 aa  89.4  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.41 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.81 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.17 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  26.2 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  55.71 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.92 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.29 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.48 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  32.84 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  30.38 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.37 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.08 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.36 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.12 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  27.1 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.76 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  27.41 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.97 
 
 		 248 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.83 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.04 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.87 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  45.95 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  32.26 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.14 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  25.93 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.72 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.32 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  32 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.82 
 
 		 247 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.93 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  29.76 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  29.75 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  37.6 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.64 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.55 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.01 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.15 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.91 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.72 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  51.56 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  45.12 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  27.78 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  28.85 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.51 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.89 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.48 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  27.78 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.64 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.59 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3513  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.15 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.07 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0061  fic family protein  27.31 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  34 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.85 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  24 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.61 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.55 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.74 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.49 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  27.46 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.14 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.32 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  29.41 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  26.79 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.14 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.91 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.19 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.79 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.56 
 
 		 412 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  31.54 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.45 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  34.65 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  29.48 
 
 		 502 aa  65.9  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.1 
 
 		 427 aa  65.9  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.44 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  31.71 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>